Estimations intégratives des incidences régionales des syndromes grippaux en France par utilisation de données de délivrances médicamenteuses - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2014

Estimations intégratives des incidences régionales des syndromes grippaux en France par utilisation de données de délivrances médicamenteuses

Cyril Esnault

Résumé

Policies to prevent and fight against epidemics of influenza-like illness (ILI) require epidemiological surveillance continuously, based on the statements in real-time GPs volunteers. The weekly calculation of incidences at national and regional level allows us to estimate the spatial distribution of outbreaks in France. However, the stability of these estimates varies over time and across regions. This work aims to improve regional estimates using external data source, based medication sales. Two areas of study are presented here: one consists in the "spatial disaggregation" of a model fitted on national sales, the other in "spatial extrapolation" of a model fitted on sales in Rhône-Alpes, French region chosen for the stability of its incidences. For this, a preselection procedure of drug classes related to ILI was developed by classification methods. Similarly, different models of periodic regression (log-linear, log-nonlinear and PLS-Poisson) and approaches (unmoving or moving models with fixed or unfixed parameters) were compared to select the best model for predicting the incidences. The spatial "disaggregation" and "extrapolation" allowed us to propose new regional estimates of the incidences, of better stability. Finally, a bootstrap was used to estimate a confidence interval around the new predictions.
Les politiques de prévention et de lutte contre les épidémies de syndromes grippaux nécessitent une surveillance épidémiologique en continue, basée sur les déclarations en temps réel de médecins généralistes bénévoles. Le calcul hebdomadaire des incidences au niveau national et régional permet d’estimer la répartition spatiale des épidémies en France. Toutefois, la stabilité de ces estimations varie au cours du temps et selon les régions. Ce travail vise donc à améliorer les estimations régionales en utilisant une source de données externe, la base des délivrances médicamenteuses. Deux axes d’études sont ici présentés : l’un consiste en la « désagrégation spatiale » d’un modèle ajusté sur les délivrances nationales, l’autre en « l’extrapolation spatiale» d’un modèle ajusté sur les délivrances en Rhône-Alpes, région choisie pour la stabilité de ses incidences. Pour cela, une procédure de présélection de classes médicamenteuses en lien avec les syndromes grippaux a été développée, par des méthodes de classification. De même, différents modèles de régression périodique (log-linéaire, log-non linéaire et PLS-poisson) et différentes approches (modèles glissants ou non, à paramètres fixés ou non fixés) ont été comparés afin de sélectionner le meilleur modèle de prédiction des incidences. La « désagrégation » et « l’extrapolation » spatiales ont alors permis de proposer de nouvelles estimations des incidences régionales, de meilleures stabilités. Enfin, un bootstrap a permis d’estimer un intervalle de confiance des nouvelles prédictions.
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Dates et versions

dumas-01105254 , version 1 (20-01-2015)

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  • HAL Id : dumas-01105254 , version 1

Citer

Cyril Esnault. Estimations intégratives des incidences régionales des syndromes grippaux en France par utilisation de données de délivrances médicamenteuses. Sciences agricoles. 2014. ⟨dumas-01105254⟩
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