Représentation des diagnostics de tumeurs utilisés par les registres des cancers par l’intermédiaire du NCI thesaurus : évaluation de cette terminologie comme outil pour l’utilisation conjointe de données en cancérologie

Résumé : Contexte : Plusieurs terminologies sont utilisées en routine pour coder les diagnostics de cancer. Pour pouvoir utiliser conjointement des informations issues de différentes sources, il faut être en mesure de mettre en correspondance les diagnostics semblables entre eux, codées à l’aide de ces différentes terminologies, c’est à dire de rattacher sous un même concept des codes différents, et ce sans modification ou perte d’information. Le NCI thesaurus (NCIt) a semblé être une terminologie de choix pour l’élaboration d’une terminologie pivot afin de représenter de manière consensuelle et centralisée les concepts des différentes terminologies diagnostiques en cancérologie. La CIM-O3 a été choisie pour débuter le travail de mapping vers cette terminologie cible. Objectif : L’objectif était d’évaluer la possibilité de représenter les données diagnostiques d’un registre général des cancers de l’adulte grâce à des concepts du NCIt, par l’intermédiaire d’un mapping validé établi préalablement entre la CIM-O3 et le NCIt et des relations existant entre les concepts du NCIt. Méthode : Une première phase a consisté en l’élaboration d’un mapping de la CIM-O3 vers le NCIt. La seconde phase s’est attachée à évaluer la possibilité de représenter les diagnostics réels du Registre Général des Cancers de la Gironde (RGCG), codés en CIM-O3, avec des concepts du NCIt. Pour chaque phase, une validation manuelle par une équipe de médecins a été réalisée. Résultats : Au 31 janvier 2015, la validation par l’équipe de médecins avait permis d’obtenir 605 mappings valides d’un code CIM-O3 vers un code NCIt (40,3% des 1500 codes CIM-O3). Il existait 21 694 tumeurs (52,20% des 41 553 tumeurs enregistrées par le RGCG durant la période d’inclusion) ayant un mapping complet de leur diagnostic. Au total, 7822 tumeurs (18,8% des 41 553 tumeurs du RGCG) avaient un diagnostic qui pointait vers un diagnostic NCIt pré-coordonné valide.
Type de document :
Mémoires
Médecine humaine et pathologie. 2015
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Contributeur : Bu Carreire Université de Bordeaux <>
Soumis le : mardi 29 septembre 2015 - 10:26:15
Dernière modification le : mercredi 23 août 2017 - 16:29:28
Document(s) archivé(s) le : mercredi 30 décembre 2015 - 10:24:33

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Bérénice Bréchat-Huet. Représentation des diagnostics de tumeurs utilisés par les registres des cancers par l’intermédiaire du NCI thesaurus : évaluation de cette terminologie comme outil pour l’utilisation conjointe de données en cancérologie. Médecine humaine et pathologie. 2015. 〈dumas-01206467〉

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