Détection et quantification des variants du virus de l'hépatite B résistants à la lamivudine et à l'adéfovir par PCR sélective en temps réel
Résumé
Une technique sensible de PCR sélective en temps réel basée sur la stratégie ARMS (Amplificatory Refractory Mutation System) a été développée pour étudier les mutations rtM204I/V et rtN236T associées à la résistance à la lamivudine et à l'adéfovir, analogues nucléos(t)idiques utilisés dans le traitement de l'hépatite B chronique. La PCR sélective a été évaluée sur des mélanges de plasmides mutés et sauvages construits par clonage, et sur des sérums de patients. Ses performances ont été comparées au séquençage direct et à une technique d'hybridation inverse (INNO-LiPA). La PCR sélective était capable de détecter une population minoritaire présente à 0,1% quand la population plasmidique totale était >104 copies. Elle a également permis une meilleure détection des populations minoritaires que le séquençage. Le test INNO-LiPA a semblé plus adapté pour étudier les variants minoritaires présents dans les sérums de faibles charges virales.
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