Association between texture analysis parameters and biomarkers (EGFR, KRAS, ALK) in pulmonary adenocarcinoma - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2016

Association between texture analysis parameters and biomarkers (EGFR, KRAS, ALK) in pulmonary adenocarcinoma

Association entre hétérogénéité tumorale mesurée en scanner et biomarqueurs (EGFR, KRAS, ALK) dans les adénocarcinomes pulmonaires

Résumé

Purpose: To determine if texture parameters derived from unenhanced computed tomography (CT) images of primary lung adenocarcinomas were related to mutational characteristics of these tumors. Methods: One hundred and thirty-two consecutive patients who underwent transthoracic lung core biopsy showing primary lung adenocarcinoma were included in this monocentric retrospective study. EGFR mutations, KRAS mutations and ALK rearrangements were systematically tested. Tumor texture analysis was performed on non-enhanced CT. Heterogeneity analysis relative to pixel distribution was performed using six parameters: mean attenuation (average brightness), standard-deviation (variation from the mean i.e. width of the histogram), entropy (global irregularity), skewness (asymmetry of the curve) and kurtosis (peakedness of the curve). Pixel distribution histograms were derived using 6 spatial scale filter (SSF) values: i.e., without-filtration (SSF 0), using fine (SSF 2); medium-coarse (SSF 3, 4); and coarse (SSF 5, 6) texture scales. Correlations between texture parameters and EGFR, KRAS, and ALK mutational status were studied. Statistical analysis comprised univariate and multivariate analyses. Results: 40/132 (30%) patients showed KRAS mutations, 9/132 (6.8%) EGFR mutations, and 5/132 (3.8%) ALK rearrangements. Significant parameters for each mutation were: for KRAS mutations, mean attenuation using medium-coarse texture (SSF 4) (AUC=0.64, Sensitivity (Se),82%); for EGFR mutations, MPP with medium texture (SSF3) (AUC=0.71, Se=81%); for ALK rearrangements, standard deviation using fine textures (AUC=0.84, se=100%). Conclusion: CT texture parameters obtained from unenhanced CT are significantly associated with primary lung adenocarcinoma mutations.
Objectif : Etude du lien entre hétérogénéité tumorale mesurée en scanner non injecté et statut pour les biomarqueurs habituels dans les adénocarcinomes pulmonaires. Méthode : Cette étude rétrospective monocentrique a inclus 132 patients qui avaient bénéficié d’une biopsie pulmonaire trans-thoracique retrouvant un adénocarcinome pulmonaire et chez qui les mutations EGFR, KRAS et la translocation ALK avaient été recherchées. Six paramètres provenant de l’histogramme de densité des pixels des tumeurs sur des scanners non injectés caractérisaient l’hétérogénéité tumorale : l'atténuation moyenne, la déviation standard, l'entropie (degré d’organisation), la moyenne des pixels positifs (MPP), le « skewness » (asymétrie de la courbe), le « kurtosis » (coefficient d’aplatissement). Ils étaient étudiés sans filtration (SSF0) puis pour cinq degrés de filtration spatiale différents, du plus fin (SSF2) au plus grossier (SSF6). Une analyse statistique univariée et multivariée a étudié le lien entre ces paramètres d’hétérogénéité et le statut des biomarqueurs. Résultat : 40/132 (30%) patients avaient une mutation KRAS, 9/132 (6.8%) une mutation EGFR et 5/132 (3.8%) une translocation ALK. Les paramètres significatifs étaient pour la mutation KRAS l’atténuation moyenne au filtre moyen (SSF4) (AUC=0.64, Se=82%), pour la mutation EGFR, MPP au filtre moyen (SSF3) (AUC=0.71, Se=81%) et pour la translocation ALK, la déviation standard au filtre fin (AUC=0.84, Se=100%). Conclusion : Il existe dans notre série un lien statistique entre caractère d’hétérogénéité tumorale mesurée en scanner et le statut pour les biomarqueurs dans les adénocarcinomes pulmonaires.
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Dates et versions

dumas-01387576 , version 1 (25-10-2016)

Identifiants

Citer

Tristan Schwab. Association between texture analysis parameters and biomarkers (EGFR, KRAS, ALK) in pulmonary adenocarcinoma. Human health and pathology. 2016. ⟨dumas-01387576⟩
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