Choix et impact d’un algorithme diagnostique pour les infections à Clostridium difficile : de la compréhension de la physiopathologie de l’infection au choix de la méthode diagnostique - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2016

Choice and impact of changes in Clostridium difficile testing practices in hospital laboratory

Choix et impact d’un algorithme diagnostique pour les infections à Clostridium difficile : de la compréhension de la physiopathologie de l’infection au choix de la méthode diagnostique

Résumé

Clostridium difficile is recognised as the leading cause of nosocomial antibiotic-associated diarrhoea in developed countries. In recent years, many studies have described the bacterium spreading further into the community and an increase in the incidence and severity of nosocomial C. difficile infection (CDI) in North America and Europe. Advances in the study of microbiota resulted to better understand the pathophysiology of CDI. Nevertheless, the biological diagnosis of CDI remains complex. This work is intended to describe the current knowledge regarding the CDI pathophysiology and to define criteria for choosing a diagnostic method to set up in a bacteriology laboratory CDI is a good model to understand the role of the gut microbiota in preventing the development of pathogens. We reviewed the current scientific analyses about the gut microbiota equilibrium changes to understand the promotion of spore germination, growth of vegetative forms and toxin production leading to CDI. Many tests are available for CDI diagnosis. They are included in a two-step algorithm diagnosis, including first the detection of the glutamate dehydrogenase (GDH) as a screening method and second the detection of toxins as a confirmatory method. We evaluated the accuracy of the novel chemiluminescence-based method detecting C. difficile GDH and free toxins A/B (DiaSorin algorithm) to an enzyme-immunoassay (EIA) for GDH with a molecular toxins test (Meridian algorithm), EIA-GDH and an EIA-toxins A/B algorithm (Alere algorithm) with and without toxigenic culture for confirmation. Finaly, we describe the adoption of nucleic acid amplification tests (NAAT) for C. Difficile diagnosis and their impact on stool rejection policies and C. difficile positivity rates in nine laboratories in the South-West of France.
Clostridium difficile est une bactérie opportuniste qui est le premier microorganisme enthéropathogène responsable d’infection nosocomiale aux États-Unis et de diarrhées associées aux soins dans les pays industrialisés. La physiopathologie de l’infection à Clostridium difficile (ICD) est aujourd’hui de mieux en mieux connue grâce aux avancées dans l’étude des microbiotes mais son diagnostic biologique demeure complexe malgré la grande diversité des tests disponibles. L’objet de ce travail a été d’appréhender la physiopathologie de l’infection pour mieux aider à choisir la méthode diagnostique à mettre en place dans un laboratoire et d’en étudier l’impact. Nous avons réalisé une revue de la littérature actuelle pour étudier et comprendre le modèle d’une ICD qui est liée principalement à un déséquilibre du microbiote intestinal. Ensuite, nous avons réalisé une analyse comparative de différentes stratégies diagnostiques au sein du CHU de Bordeaux. Nous avons ainsi évalué un nouvel algorithme diagnostique fondé sur la chimioluminescence (LIAISON® C. difficile GDH Assay, DiaSorin suivi du LIAISON® C. difficile Toxins A&B, DiaSorin) en le comparant à trois autres approches algorithmiques : C. diff Quik Chek GDH® suivi par TOX A/B Quik Chek® (Alere) avec ou sans culture toxigénique pour confirmation et un algorithme comprenant un test moléculaire, EIA ImmunoCard® C. difficile GDH (Meridian) suivi par une PCR isothermique illumigene®, (Meridian) pour la détection de l’îlot de pathogénicité PaLoc portant les gènes des toxines. Enfin, pour aller plus loin dans cette démarche, nous avons évalué l’impact de l’introduction d’un test de biologie moléculaire sur la politique de rejet des selles et le taux de résultats positifs au sein de neuf laboratoires du Sud-Ouest de la France.
Fichier principal
Vignette du fichier
Med_spe_2016_Blanchi.pdf (12.48 Mo) Télécharger le fichier
Loading...

Dates et versions

dumas-01421430 , version 1 (22-12-2016)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-01421430 , version 1

Citer

Julie Blanchi. Choix et impact d’un algorithme diagnostique pour les infections à Clostridium difficile : de la compréhension de la physiopathologie de l’infection au choix de la méthode diagnostique . Médecine humaine et pathologie. 2016. ⟨dumas-01421430⟩
93 Consultations
345 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More