La théorie des équilibres ponctués (TEP) : quelles explications de l'explication ?

Résumé : L’objectif principal est d’analyser et de synthétiser un certain nombre d’hypothèses proposées comme “mécanismes” pour expliquer la TEP et notamment celui “d’accomodation génétique” proposé par Mary Jane West-Eberhard dans son œuvre fondamentale et influente de 2003 "Developmental Plasticity and Evolution", cité plus de 4000 fois dans la littérature scientifique . Elle y propose l’une des explications les plus originales du patron de stases et de spéciation rapide observé dans strates fossiles : “ The plasticity hypothesis of punctuated evolution proposes that developmental plasticity in the expression of contrasting or antagonistic traits promotes stasis in multipurpose morphology, and that accelerated morphological change occurs when a formerly optional state increases in frequency of expression or becomes fixed, causing a temporary burst of rapid directional change in associated quantitatively variable morphology (West-Eberhard 2003, pp. 617-618). ” L’enjeu ici, sera de comprendre la structure de cette explication vis-à-vis de la TEP. S’agit-il d’une explication ? Et d’un mécanisme ? En quel sens ? Si oui, cela peut-il contenter les critiques évoquées précédemment ? A bien des égards, cette question est une formidable expérience de philosophie et de science. Sur le plan philosophique, la TEP et l’hypothèse d’accommodation phénotypique nous donnent un système où il est possible d’étudier le problème de l’explication (et le concept associé de cause). Elle nous permettra notamment d'aborder la fameuse dichotomie souvent faite en biologie entre causes prochaines et causes ultimes proposée par E. Mayr (1961). Toujours sur le plan philosophique, elle nous permettra d’étudier la question des mécanismes en biologie. Vaste question dont cet exemple particulier nous permettra d’analyser le problème d’échelle : un mécanisme, en biologie, se situe-t-il nécessairement au niveau le plus faible (physico-chimique) ? Pour répondre à ces questions, il nous faudra d’abord comprendre les grandes lignes de la TEP : son origine, sa structure, ses prédictions et implications et les critiques dont elle a été la cible. Cette synthèse nous permettra de mieux cibler en quoi l’accommodation phénotypique et les autres explications récentes contribuent à la TEP. Il s’agira là de se livrer à un véritable exercice d’épistémologie historique, selon l’approche que j’ai évoquée dans cette introduction. Sur le plan scientifique, le travail philosophique permettra d’alimenter une analyse moderne de la littérature actuelle pouvant suggérer de nouvelles pistes de recherche pour la TEP et même proposer quelques expériences. Pour répondre à cet objectif, le mémoire sera divisé en deux grandes parties. Les premières parties, via une chronologie de la TEP, détailleront son origine, sa structure et les critiques. Les concepts de “cause”, “mécanisme” et “explication” étant omniprésent dans le débat autour de la TEP, ces points de philosophie de la biologie seront traités au fur et à mesure de la chronologie. Les dernières parties du mémoire s’intéresseront à la théorie de l’accommodation génotypique au sens large : ses propositions, sa contribution à la TEP, les résultats récents et le cadre expérimental pouvant être envisagé pour tester son rôle explicatif vis-à-vis de la TEP. Dans la conclusion, je reviendrai sur les conséquences philosophiques de ce travail.
Type de document :
Mémoires
Philosophie. 2016
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Soumis le : jeudi 12 janvier 2017 - 16:45:17
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Alexandre Peluffo. La théorie des équilibres ponctués (TEP) : quelles explications de l'explication ?. Philosophie. 2016. 〈dumas-01433530〉

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