Création et validation d’un filtre de recherche en médecine générale sur PubMed

Résumé : Les médecins généralistes rencontrent des difficultés lorsqu’il s’agit de rechercher une information pertinente dans MEDLINE via PubMed. L’objectif de cette étude était d’élaborer un filtre de recherche en médecine générale sur PubMed afin de faciliter la recherche d’information pertinente pour la médecine générale.
Méthode :
Nous avons construit un Gold Standard (GS) de référence en médecine générale à partir d’une analyse manuelle d’un échantillon de références indexées en 2014 issues de 8 revues. Une analyse de fréquence des termes MeSH et une analyse statistique ont permis d’identifier des candidats pour la constitution du filtre de recherche. Des combinaisons ont été testées sur le GS et validées dans un deuxième groupe de références. Les résultats ont ensuite été comparés aux filtres existants.
Résultats :
7602 articles ont été analysés manuellement. Le GS était composé de 512 références pertinentes pour la médecine générale. 6099 termes MeSH différents ont été extraits du groupe 1. 13 MeSH avaient un F-score supérieur à 5% ont été sélectionnés parmi les 30 plus fréquents. L’équation 1, composée des 5 termes ayant un risque relatif MEDLINE (RR) supérieur à 10, obtenait un rappel à 13,28%, une précision à 11,49%, un Fscore à 12,32% et une spécificité à 85%. L’équation 2, composée des 8 termes ayant un RR supérieur à 7, obtenait un rappel à 22,61%, une précision à 13,16%, un F-score à 16,64% et une spécificité à 78%. Les filtres de notre étude avait des scores similaires aux filtres existants.
Conclusion :
Nous avons élaboré deux filtres de recherche en médecine générale sur PubMed, l’un spécifique, l’autre plus sensible. En pratique, il semble difficile d’obtenir un filtre optimal et utilisable par le généraliste. Son utilisation pourrait dépasser le champ de la médecine générale notamment dans le domaine de l’informatique médicale.
Type de document :
Mémoires
Médecine humaine et pathologie. 2017
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Contributeur : Bibliothèque Universitaire Rouen <>
Soumis le : lundi 29 mai 2017 - 09:50:44
Dernière modification le : jeudi 7 décembre 2017 - 12:34:13
Document(s) archivé(s) le : mercredi 6 septembre 2017 - 09:50:05

Identifiants

  • HAL Id : dumas-01473723, version 1

Citation

Léonard Chansavang. Création et validation d’un filtre de recherche en médecine générale sur PubMed. Médecine humaine et pathologie. 2017. 〈dumas-01473723〉

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