Étude de deux maladies chez la carotte porte-graine causées par les espèces fongiques Fusarium tricinctum et Diaporthe angelicae - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2017

Study of two diseases in carrot seed production caused by the fungal species Fusarium tricinctum and Diaporthe angelicae

Étude de deux maladies chez la carotte porte-graine causées par les espèces fongiques Fusarium tricinctum et Diaporthe angelicae

Résumé

Recently, two fungal pathogens were identified in French’s carrot seed crops: as a new pathogen, Fusarium tricinctum, and a re-emerging pathogen, Diaporthe angelicae. In this work, 15 Fusarium strains and isolates from lesions on carrot crowns have been studied. Firstly, phenotypic and molecular typing based on ITS rDNA and β-tubulin sequences resulted in the identification of 10 F. tricinctum strains and 5 other strains belonging to three species: F. avenaceum, F. culmorum and F. redolens. Secondly, in vitro sensitivity tests of 2 F. tricinctum strains to 4 fungicides and 1 Alliaceae extract was performed demonstrating the nonsensitivity of these strains to the tested concentrations of the fungicides, whereas the Alliaceae extract (Veg`Lys®) was able to inhibit 99% of conidia germination. In addition, in vitro confrontations of three isolates of F. tricinctum against commercial and marine strains of Trichoderma sp., have been tested. Results showed that the two commercial strains were not suitable for biocontrol, while some parasitism properties were observed for the marine strain. In a second part, microscopic observations of artificially contaminated umbels showed that D. angelicae could penetrate the host through the stomata at the style basis. Finally, the localization of D. angelicae in xylem vessels and in parenchyma cells was observed highly suggesting that this fungus is a vascular pathogen.
Récemment, en culture de carotte porte-graine, un nouveau pathogène, Fusarium tricinctum, et un pathogène ré-émergent, Diaporthe angelicae, ont été identifiés. Dans ce mémoire, 15 souches de Fusarium ont été étudiées. Des analyses phénotypiques et moléculaires se basant sur les régions ITS de l’ADNr et sur le gène de la β-tubuline ont d’abord permis l’identification de 10 souches de F. tricinctum et de 5 souches de trois espèces différentes : F. avenaceum, F. culmorum et F. redolens. Un screening in vitro de sensibilité de 2 souches de F. tricinctum à 4 fongicides et à un extrait d’Alliacées a ensuite été mené. Les résultats montrent que les fongicides ne sont pas efficaces, mais que l’extrait d’Alliacées (le Veg`Lys®), permet l’inhibition de la germination de 99% des conidies de ce pathogène. De plus, des tests de confrontation de souches de F. tricinctum avec des souches de Trichoderma, ont permis de mettre en évidence la non efficacité des souches commerciales contre ce pathogène mais de mettre en avant les propriétés de parasitisme d’une souche marine de Trichoderma issue du laboratoire MMS de Nantes. Dans un second temps, des observations microscopiques d’ombelles, contaminées artificiellement avec une suspension de conidies de D. angelicae, a permis de montrer qu’une pénétration du pathogène par les stomates à la base des styles de l’hôte existe. Enfin, Il a été mis en évidence que D. angelicae se situerait dans les vaisseaux de xylème et les cellules du parenchyme de l’hôte, ce qui indique que D. angelicae serait un pathogène vasculaire.
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  • HAL Id : dumas-01627867 , version 1

Citer

Corentin Chateau. Étude de deux maladies chez la carotte porte-graine causées par les espèces fongiques Fusarium tricinctum et Diaporthe angelicae. Sciences du Vivant [q-bio]. 2017. ⟨dumas-01627867⟩
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