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Master Thesis

Les mutations « incidentes » dans le diagnostic moléculaire de la prédisposition héréditaire aux cancers : nouvel enjeu du séquençage de nouvelle génération

Résumé : Une mutation des gènes majeurs de prédisposition héréditaire BRCA est retrouvée dans 15 % des cas de syndrome sein-ovaire. La technique NGS en panel de gènes permet l’étude d’autres gènes de prédispositions aux tumeurs que ceux a priori impliqués dans l’indication recherchée. Le but de cette étude est de déterminer si la détection de variants incidents est corrélée avec l’indication et le phénotype familial évalué par le score de Manchester. Étude de 2013 à 2015 sur 1819 patients criblés pour suspicion de cancer héréditaire du sein ou de l’ovaire, de syndrome de Lynch, de Gorlin ou de Cowden. Le panel de gènes comprend 25 gènes capturés (Sureselect XT Agilent) et séquencés (MiSeq Illumina): APC, ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, MLH1, MRE11A, MSH2/EPCAM, MSH6, MUTYH, PALB2, PIK3CA, PMS2, PTCH1, PTCH2, PTEN, RAD50, RAD51C, STK11, SUFU et TP53. Dans le syndrome héréditaire sein-ovaire, des mutations délétères de BRCA ont été caractérisées dans 14,4% des cas et une mutation incidente dans 6,2%. La fréquence des mutations délétères de PALB2 et d’ATM est significativement plus importante dans le groupe étudié que dans le groupe contrôle, respectivement de 1,2 vs 0,0% (p=0,01) et de 1,9 vs 0,4% (p=0,02). L’odds ratio d’ATM est de 4,9 (IC95%=[1,1;20,8]). Par ailleurs, les mutations de PALB2 et d’ATM ne sont pas strictement exclusives des mutations BRCA. De plus, un score de Manchester élevé est corrélé à une détection augmentée du taux de mutations de BRCA mais pas de PALB2 ni d’ATM. Une association significative entre les mutations d’ATM et une histoire familiale de cancers du pancréas a été mise en évidence. Ces résultats valident la contribution de PALB2 et d’ATM dans les cancers héréditaires du sein et de l’ovaire. Il conviendra de mener une étude sur une plus large population afin de mettre en évidence une association statistiquement significative pour d’autres gènes, comme CHEK2 ainsi que pour obtenir d’autres odds ratios afin d’évaluer les risques tumoraux.
Document type :
Master Thesis
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https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-01674947
Contributor : Bu Carreire Université de Bordeaux <>
Submitted on : Wednesday, January 3, 2018 - 6:07:55 PM
Last modification on : Saturday, January 13, 2018 - 1:22:37 AM
Long-term archiving on: : Thursday, May 3, 2018 - 7:27:43 AM

File

Med_spe_2017_Macquere.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : dumas-01674947, version 1

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Citation

Pierre Macquère. Les mutations « incidentes » dans le diagnostic moléculaire de la prédisposition héréditaire aux cancers : nouvel enjeu du séquençage de nouvelle génération. Médecine humaine et pathologie. 2017. ⟨dumas-01674947⟩

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