Diatomées et centrifugation : évaluation des résultats par acquisition scanner - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2019

Diatoms and centrifugation: results analysis by scanner acquisition

Diatomées et centrifugation : évaluation des résultats par acquisition scanner

Résumé

Introduction: The diatom test is recognized as essential in forensic to diagnose drowning. However, this test still presents many biases and application issues. We are looking to improve methods the current for identifying and counting diatoms. Materials et method: On a solution loaded with diatoms, we applied two different chemical treatments: one combining the use of hydrochloric acid and heated hydrogen peroxide, and the other using sodium hypochlorite. We then centrifuged the processed solutions at different speeds and durations. After staining with methylene blue, one drop of each sample was placed and fixed on a slide. These slides were digitally scanned, then the diatoms were counted over a defined area, by differentiating between intact and fractured diatoms. Results: The use of hydrochloric acid and heated hydrogen peroxide is effective in removing impurities. A centrifugation at 500 rpm for 5 minutes is ideal for collecting as many diatoms as possible. The digitization of slides by microscopic scanning has proven to be an essential tool in the identification of diatoms. Discussion: These results have yet to be confirmed by a much larger number of samples and automated counting software for more exhaustive identification of diatoms.
Introduction : Le test de la diatomée est reconnu comme indispensable en médecine légale pour poser le diagnostic de noyade. Cependant ce test présente aujourd’hui encore de nombreux biais et difficultés d’application. Nous recherchons à améliorer les méthodes d’identification et de comptage des diatomées. Matériel et méthode : Sur une solution chargée en diatomée, nous avons appliqué deux traitements chimiques différents : l’un combinant l’utilisation d’acide chlorhydrique et de peroxyde d’hydrogène chauffé, et l’autre utilisant de l’hypochlorite de sodium. Nous avons centrifugé à différentes vitesses et durées les solutions traitées. Après coloration au bleu de méthylène, une goutte de chaque échantillon a été déposée et fixée sur une lame. Ces lames ont été scannées numériquement, puis les diatomées ont été comptabilisées sur une surface définie, en différenciant les diatomées intactes des fracturées. Résultats : L’utilisation d’acide chlorhydrique et d’eau oxygénée chauffée est efficace dans l’élimination des impuretés. Une centrifugation à 500 tours par minute durant 5 minutes est idéale pour collecter le maximum de diatomées. La numérisation de lames par scanner microscopique s’est révélée être un outil incontournable dans l’identification des diatomées. Discussion : Ces résultats restent à confirmer avec un nombre d’échantillons bien plus important et un logiciel de comptage automatisé pour une identification plus exhaustive des diatomées.
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Dates et versions

dumas-02060370 , version 1 (07-03-2019)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-02060370 , version 1

Citer

Emma Lacaze Saint Jean. Diatomées et centrifugation : évaluation des résultats par acquisition scanner. Sciences du Vivant [q-bio]. 2019. ⟨dumas-02060370⟩
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