G. Enders, Le charme discret de l'intestin. Acte Sud, 2015.

, Les probiotiques, des bactéries qui nous veulent du bien. INRA (institut national de recherche en agronomie)

U. Fiche-info, . De, . Publique, and . Médicaments, Mise à jour déc 2018

, Rôle du pharmacien dans leur conseil à l'officine. LOROT F. Thèse de pharmacie, La place des probiotiques dans l'arsenal thérapeutique, 2016.

S. Jradi-hocine, Probiotique en 2017: indications thérapeutiques et preuves scientifiques. Médecine. janvier, 2018.

, Aubin Auger I. Introduction à la recherche qualitative, Exercer, vol.84, pp.142-147

M. Blais and S. Martineau, analyse inductive générale : description d'une démarche visant à donner un sens à des données brutes. Roch Qual, 2006.

A. Rapport, Comité d'interface ANSM / Organisations professionnelles Représentatives des industries des DM et des DMDIV Groupe de travail « Règlements DM/DMDIV, 2017.

B. David and . L'histoire-naturelle, pour apprendre la complexité du réel. La revue du praticien MEDECINE GENERALE, mars 2018. 10 10 millions de gènes de bactéries intestinales : le plus grand catalogue de référence. INRA, 2014.

P. Gerard, Des micro-organismes et des hommes? Rev du microbiote, Mars, vol.1, p.4, 2015.

M. A. Bigard, Le microbiote intestinal. La lettre de l'hépatogastroentérologue, Vol XXI, vol.1, pp.11-12, 2018.

E. Michaud, R. Gayet, and S. Paul, Les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI): qui dit MICI dit dysbiose La lettre de l'hépato-gastroentérologue.Vol XXI-n°1-janvier février, 2018.

, Actualité du microbiote intestinal, Ann Pharm Fr.Janv, vol.72, issue.1, pp.15-21, 2014.

, METAHIT : Metagenomics of Human Intestinal Tract

H. Nielsen, M. Almeida, and A. Juncker, Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using references genomes, Nat Biotechnol, vol.32, pp.822-830, 2014.

O. Goulet, La flore intestinale: un monde vivant à préserver, J Pédiatrie Puériculture. mai, vol.22, issue.3, pp.102-108, 2009.
DOI : 10.1016/j.jpp.2009.03.007

K. Aagaard, J. Ma, and K. M. Antony, the Placenta Harbors a Unique Microbiome, Sci Trans Med, vol.6, pp.237-65, 2014.

J. Van-der-helm, N. Paalane, and T. V. Mysore, Microbiota of the earliest stool in life: a population based study among 212 Finnish newborns, 2015.

M. C. Collado, Human gut colonisation may be initiated in utero by instinct microbial communities in the placenta and amniotic fluid, Sci Rep, vol.6, p.23129, 2016.

E. Patterson, P. M. Ryan, and J. F. Cryan, Gut microbiota, obesity and diabetes, Postgrad Med J, vol.92, pp.286-300, 2016.

H. E. Jakobsson, T. R. Abrahamsson, and M. C. Jenmalm, Decreased gut microbiota diversity, delayed bacteroides colonisation and reduced Th1 responses in infant delivered by caesarean section, Gut, vol.63, pp.559-66, 2014.

S. Mazzoleni, Reduced atopic sensitization in babies born by cesarian section supplemented by

L. Rhamnosus and G. G. , 8th Probiotics, Prébiotics and New foods for Microbiota and human health, pp.13-15, 2015.

F. M. Ruemmele and R. Closse, L'effet du mode d'accouchement sur la colonisation intestinale: conséquences immunitaires à vie? Aout, 2013.

F. Campeotto, W. Dupriet, A. J. , D. Populaire, and F. , Mise en place de la flore intestinale du nouveau né, 2008.
DOI : 10.1016/s0399-8320(07)89424-3

C. Landman and E. Quevrain, Le microbiote intestinal :description, rôle et implication physiopathologiques, Rev Med Int, vol.37, pp.418-441, 2016.
DOI : 10.1016/j.revmed.2015.12.012

, Programme national nutrition santé, allaitement maternel, Fév, 2005.

C. Pd and N. M. Delzenne, Lipides et inflammation post prandiale: impact du microbiote intestinal, 2011.

J. Doré, Que l'écologie microbienne soit prise en compte dans la médecine de demain, Rev du microbiote. Mars, vol.1, pp.18-20, 2015.

. Forslund-k, . Hildebrand-f, and T. Nielsen, Disentangling type 2 diabetes and metformine treatment signatures in the human gut microbiota, Nature, vol.528, pp.262-268, 2015.

. Bull and . Acad, Nathe Med, vol.9, pp.1667-1684, 2014.

R. Burcelin, L. Zltvogel, and G. Fond, Microbiote intestinal et santé, 2016.

J. F. Patterson-e,-cryan and G. F. Fitzgerald, Gut microbiota, the pharmabiotics they produce and host health, Proc Natr Soc, vol.73, pp.477-89, 2014.

M. Neunlist, L'axe intestin-cerveau: un rôle central dans le développement de nombreuses maladies. rev du microbiote, Oct, vol.6, pp.15-16, 2016.

C. Landman and E. Quevrain, Le microbiote intestinal :description, rôle et implication physiopathologiques, Rev Med Int, vol.37, pp.418-441, 2016.
DOI : 10.1016/j.revmed.2015.12.012

C. Zallot, Transplantation de microbiote fécal et pathologies digestives. La lettre de l'hépatogastroentérologue, Jan-Fév, vol.XXI, pp.43-50, 2018.

. Bertin, Les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin: aspects immunologiques, 2013.

P. A. Apoil, Bases immunologiques de la tolérance orale, Rev Fr Allegro. Avr, vol.53, issue.3, pp.239-281, 2013.
DOI : 10.1016/j.reval.2013.01.035

J. M. Norman, S. A. Handley, and M. T. Baldridge, Diesease-specific alterations in the enteric virome in inflammatory bowel disease, Cell, vol.160, pp.447-60, 2015.

Q. H. Sam, M. W. Chang, and L. Y. Chai, The fungal mycobiome and its interaction with gut bacteria in the host, int J Mol Sci, vol.18, 2017.

. Gastro-entérologie-hépatologie and . Prescrire, TOME, vol.37, p.399, 2017.

F. Joly, . Coffin-b, and B. Messing, Rôle de la flore dans les pathologies digestives (maladie de Croh, rectocolite ulcérohémorragiques, cancer colorectal exclus, vol.25, 2007.
DOI : 10.1016/j.nupar.2007.04.004

M. A. Jackson, J. K. Goodrich, and M. E. Maxan, Pronton pump inhibitors alter the composition of the gut microbiota, Gut, 2015.

, Bruley des Varannes S. Les IPP peuvent-ils être largement utilisés sans risque pour le microbiote intestinal? Rev du microbe, Mars, vol.4, p.15, 2016.

D. Compare, A. Rocco, and C. Sgamato, Lactobacillius paracasei F19 versus placebo for the prevention of proton pump inhibitor-induced bowel symptoms: a randomized clinical trial, Dig Liver Dis, vol.47, pp.273-282, 2015.

M. C. Moreau, P. Raibaud, and M. C. Muller, Relationship between the development of the intestinal IgA

, Ann Immunol, vol.1330, issue.1, pp.29-39, 1982.

J. M. Bohbot, Le microbiote vaginal: un élément fondamental de l'équilibre vaginal et de la protection vis-à-vis des infections endogènes et exogènes. Rev du microbiote, Mars, vol.1, pp.10-11, 2015.

C. Collège, . Des, . Et, and . Français, Extrait des Mises à jour en Gynécologie Médicale, 2007.

Y. Belkaid and J. A. Segre, Dialogue between skin microbiota and immunity, Science, vol.346, pp.954-963, 2014.
DOI : 10.1126/science.1260144

J. Morris, Chapter 26: Bacteria and Archea in Biology: How Life Works. Ed WH Freeman and compagny, 2013.

Y. Belkaid and S. Tamoutounour, The influence of skin microorganisms on cutaneous immunity, Nat Rev Immunol, vol.16, pp.353-66, 2016.

B. Dreno, Le microbiote cutané, régulateur de l'immunité innée de la peau, Mars, vol.7, pp.15-21, 2017.

M. Dominguez-bello, Delivery mode shapes the acquisition and structure of the initial microbiota across multiple body habitats in newborns, Proc Natl Acad Sci USA, vol.107, pp.11971-11976, 2010.

K. Capone, Diversity of the human skin microbiome early in life, J Invest Dermatol, vol.131, pp.2026-2058, 2011.

, Effets des probiotiques et prébiotiques sur la flore et l'immunité de l'homme adulte, AFSSA. Février, 2005.

B. Thimoleon, Contrôle des probiotiques. SCL -Laboratoire de Rennes, 2010.

. Inrap,

P. Gérand and . Li-shizhen, 1518-1593) et la soupe jaune, Rev du microbiote. Juin, vol.5, p.20, 2016.

. Notre-histoire.-deuxième-Époque, Institut Pasteur, pp.1862-1877

T. M. Batista and E. T. Marques, Draft Genome Sequence of the Probiotic Yeast Saccharomyces cerevisiae var. boulardii Strain ATCC MYA-796, Genome Announc, 2014.

V. Gupta and R. Garg, Probiotics. Indian J Med Microbiol, vol.27, issue.3, pp.202-211, 2009.

K. C. Anukam and G. Reid, Probiotics: 100 years (1907-2007) after Elie Metchnikoff's observation, Commun Curr Res Educ top Trends Appl Microbial, vol.1, pp.466-74, 2007.

. Histoire and . Probiotiques, Lallemand Solutions Santé. R & D

P. Marteau and J. Doré, Le microbiote intestinal, un organe à part entière, 2017.

C. Graf, Probiotiques: efficacité et dangerosité. Rev Médicale Suisse

E. Vidal, Probiotiques. mis à jour : Lundi 18 Août, 2014.

E. F. Zein, S. Karaa, A. Chemaly, and I. Saiidi, Septicémie à lactobacillius rhamnosus chez une patiente diabétique prennent un traitement probiotqiue, Les probiotiques aujourd'hui: Où en est-on? Bultel A.Thèse Pharmacie. Université Lille, vol.66, pp.195-203, 2008.

F. Z. Chiokh, H. B. Hmida, and K. B. Ameur, Septicémie à Saccharomyces cervisae chez les prématurés traités par Ultralevure®, 2013.

. I-n-f-o-s-a-n-.-r-a-p-p-o-r-t-d-'-a-c-t-i-v-i-t,

, Intérêt de l'utilisation des probiotiques dans la prise en charge des vulvovaginites récidivantes. Guéry C. Thèse médecine. Université Poitiers, 2017.

M. J. Butel, Les probiotiques et leur place en médecine humaine, J Anti-infect. juin, vol.16, issue.2, pp.33-43, 2014.

, ULTRA-LEVURE) : ajout d'une contre-indication chez les patients en état critique ou immunodéprimés, Lettre aux professionnels de santé. Saccharomyces boulardii, 2018.

, La taxonomie du vivant (dite également systématique).Rev du microbiote, vol.9, p.24, 2017.

A. Rapport, Effets des probiotiques et prébiotiques sur la flore et l'immunité de l'homme adulte. Février, 2005.

A. Compte-rendu-de-séance, Comité d'interface ANSM / Organisations professionnelles Représentatives des industries des DM et des DMDIV, 2017.

B. Pot, Les allégations de santé en Europe: une histoire compliquée? Rev du microbiote, Juin, vol.2015, issue.2, pp.17-18

, INRA.Les probiotiques, des bactéries qui nous veulent du bien. Dossier de presse mis à jour LE

E. A. Parker and T. Roy, Probiotics and gastrointestinal conditions: An overview of evidence from the Cochrane Collaboration, Nutrition, vol.45, pp.125-134, 2017.

S. J. Allen, E. G. Martinez, G. V. Gregorio, and L. F. Dans, Probiotiques pour le traitement de la diarrhée aiguë d'origine infectieuse. Cochrane. 8 décembre, 2010.

S. Guandalini, L. Pensabene, and M. A. Zikri, Lactobacillus GG administered in oral rehydration solution to children with acute diarrhea: a multicenter European trial, J Pediatr Gastroenterol Nutr, vol.30, issue.1, pp.54-60, 2000.

O. Goulet, Effets de Saccharomyces boulardii dans le traitement et la prévention des diarrhées de l'enfant. J pédiatrie puériculture, vol.22, pp.337-377, 2009.

. Szajewska-h, M. Urbanska, and A. Chmielewska, Meta-analysis: Lactobacillius reuteri strain DSM 17938 (and the original strain ATCC 55730) for treating acute gastroenteristis in chindren, Benef Microbes. sept, vol.5, issue.3, pp.285-93, 2014.

H. Szajewska, A. Guarino, and I. Hojsak, Use of Probiotics for Management of Acute Gastroenteritis: A Position Paper by the Espghan Working Group for Probiotics and Prebiotics, J Pediatric Gastroenterol Nutr, vol.58, issue.4, pp.531-540, 2014.

. Schneider-s, Quels probiotiques utiliser en hépato-gastroentérologie, quand et comment? : Flore intestinale et probiotiques. La lettre de l'hépato-gastroentérologue, vol.14, pp.171-175, 2011.

H. Duboc, Diarrhée aiguë et probiotiques: trois situations pratiques confrontées à l'evidence-based medicine. La lettre de l'hépato-gastroentérologue, vol.12, pp.100-103, 2009.

H. Szajewska, Probiotics in the treatment and prevention of acute infectious diarrhea in infants an children : A systematic review of published randomized, double-blind, placebo-controlled trials, Journal of pediatric gastroenterology and Nutrition, vol.33, pp.17-25, 2001.

W. Cornelius, Van Niel et al, lactobacillus therapy for acute infectious diarrhea in children: a meta-analysis, Pediatrics, vol.109, 2002.

C. Graf and F. P. Sarasin, Probiotiques: efficacité et dangerosité, Rev Med Suisse, vol.3, issue.129, pp.2350-2354, 2007.

L. V. Mcfarland, Meta-analysis of probiotics for the prevention of traveler's diarrhea, Travel Med Infect Dis. Mars, vol.5, issue.2, pp.97-105, 2007.

A. E. Pérez-cobas, M. J. Gosalbes, and A. Friedrichs, Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multiomic approach, Gut, vol.62, pp.1591-601, 2013.

L. Dethlefsena and D. Relmana, Incomplete recovery and individualized responses ofthe human distal gut microbiota to repeated antibiotic perturbation, Proc Natl Acad Sci, vol.108, pp.4554-61, 2011.

S. Blaabjerg, D. M. Artzi, and R. Aabenhus, Probiotics for the Prevention of Antibiotic-Associated Diarrhea in Outpatients-A Systematic Review and Meta-Analysis. Antibiotics (Basel), vol.6, 2017.

C. Mantegazza, P. Molinari, D. , and A. E. , Probiotics and antibiotic-associated diarrhea in children: A review and new evidence on Lactobacillus rhamnosus GG during and after antibiotic treatment, Pharmacol Res, issue.17, pp.30923-30927, 2017.

J. Z. Goldenberg, L. Lytvyn, J. Steurich, P. Parkin, S. Mahant et al., Probiotics for the prevention antibioticassociated diarrhea in children, 2015.

J. Z. Goldenberg, Probiotiques pour la prévention de la diarrhée associée aux antibiotiques (DAA) en pédiatrie. IBD Group Cochrane, 2011.

H. Szajewska, B. Canani, R. Guarino, and A. , Probiotics for the Prevention of Antibiotic-Associated Diarrhea in Children. On Behalf of the ESPGHAN Working Group for Probiotics/Prebiotics, vol.62

M. C. Zanella-terrier, L. Simonet, M. Frossard, and J. L. , Récidives d'infection à Clostridium difficile : l'importance du microbiote intestinal, Rev Med Suisse, vol.9, pp.1898-1904, 2013.

J. Goldenberg, C. Yap, L. Lytvyn, and C. K. Lo, Probiotics for the prevention of Clostridium difficile-associated diarrhea in adults and children. Cochrane Database Syst Rev, vol.12, 2017.

B. C. Johnston, L. Lytvyn, and C. K. Lo, Microbial Preparations (Probiotics) for the Prevention of Clostridium difficile Infection in Adults and Children: An Individual Patient Data Meta-analysis of 6,851 Participants, Infect Control Hosp Epidemiol, vol.39, issue.7, pp.771-781, 2018.

J. Z. Goldenberg, D. Mertz, and B. C. Johnston, Probiotics to Prevent Clostridium difficile Infection in Patients Receiving Antibiotics, JAMA, vol.320, issue.5, pp.499-500, 2018.

P. Ducrotte, P. Sawant, and V. Jayanthi, Essai clinique: Lactobacillius plantarum 299v (DSM 9843) améliore les symptomes du syndrome de l'intestin irritable, World Gastroentérol, vol.18, issue.30, pp.4012-4030, 2012.

B. Eiseman, . Silen-w, and G. S. Bascom, Fecal enema as an adjunct in the treatment of pseudomembranous enterocolitis, Surgery, vol.44, pp.854-863, 1958.

M. Austin, M. Mellow, and W. M. Tierney, Fecal microbiota transplantation in the treatment of Clostridium difficile infections, AM J Med, vol.127, issue.6, pp.479-83, 2014.

C. Hogenauer, P. K. Kump, and R. Krause, Tempered enthusias for fecal transplantation? Clin Infect Dis, 2014.

E. Willingham, La transplantation de microbiote fécal va-t-elle sauver la médecine moderne ?, Conference Reports IDWeek, 2018.

S. Bennet, Gut microbiota as potential orchestrators of irritable bowel syndrome, Gut Liver

M. Simren, Intestinal microbiota in fuctional bowel disorders: a Rome foundation report, Gut, vol.62, pp.159-76, 2013.

G. K. Spillerr, Postinfectious Irritable Bowel Syndrome, Gastroenterology, vol.136, pp.1979-88, 2009.

C. J. Walsh, C. M. Guinane, and . O'toole, Beneficial modulation of the gut microbiota, FEBS Lett, 2014.

J. P. Vallée, A. M. Baque-gensac, and F. Armangau-truck, Probiotiques: pas anodins en cas de pancréatite aiguë, Médecine, vol.4, issue.3, pp.102-1102, 2008.

T. Piche, Modulation by colonic fermentation of LES function in humans, Am J Physiol, vol.278, pp.578-84, 2000.

T. Piche, Colonic Fermentation influences Lower Esophageal Sphincter Function in Gastroesophageal Reflux Disease, Gastroenterology, vol.124, pp.894-902, 2003.

F. Zerbib, Clinical, but not oeusophageal pH impedance, profiles predict response to proton pump inhibitors in gastro-oesophageal reflux disease, Gut, vol.61, pp.501-507, 2012.

E. P. Halmos, A Diet Low in FODMAPs reduces Symptoms of irritable bowel Syndrome, Gastroenterology, vol.146, pp.67-75, 2014.

H. M. Staudacher, Mechanisms and efficacy of dietary FODMAP restriction in IBS, Nat Rev Gastroenterol Hepatol, vol.11, pp.256-66, 2014.

T. N. Hustoft, Fodmap diet aters symptoms, microbiota,short-chain fatty acids and cytokine profiles in patients with IBS: a randomized controlled trial. unites European Gastroenterology Week, 2016.

P. Jouet, Faut-il proposer un régime pauvre en FODMAPs aux patients ayant un syndrome de l'intestin irritable ?

. Hepato-gastro-et-oncologie-digestive, , vol.23, pp.370-375, 2016.

P. Jouet and J. M. Sabatier, Rôle du microbiote dans le syndrome de l'intestin irritable.La lettre de l'hépatogastroentérologue, 2018.

T. Pichet, Tight junctions and IBS-the link between epithelial permeability, low garde inflammation, and symptoms generation?, Neurogastroenterol Motil, vol.26, pp.296-302

D. Vandeputte, Stool consistency is strongly associated with gut microbiota richness and composition, enterotypes and bacterial growth rates, Gut, vol.65, pp.57-62, 2016.

P. Ducrotte, Physiopathologie des TFI et implications thérapeutiques, Post'U, vol.2013, pp.189-96

F. Shanahan and E. Quigley, Manipulation of the microbiota for treatment of IBS and IBD-challenges and controversies, Gastroenterology, vol.146, pp.1554-63, 2014.

J. M. Sabaté and P. Jouët, Prise en charge du Syndrome de l'Intestin Irritable (SII). SNFGE. 19 septembre, 2016.

, WGO Global Guidelines: Probiotiques et prébiotiques, World Gastroenterology Organisation, 2017.

P. Andrews, T. J. Borody, and N. P. Shortis, Bacteriotherapy for chronic constipation-along term followup, gastroenterology, vol.108, p.563, 1995.

D. M. Pinn, O. C. Aroniadis, and L. J. Brandt, Is fecal microbiota transplantation an effective treatment for patients with functional gastrointestinal disorders?, Neurogastroenterol Motil, 2014.

P. H. Johnsen, Faecal microbiota transplantation versus placebo for moderate-to-severe irritable bowel syndrome: a double blind, randomised, placebo-controlled, parallel group, single-centre trial, Lancet Gastroenterol Hepatol, 2017.

L. Mici and . France, Observatoire national des MICI, 2017.

E. Quevrain, P. Seksik, and S. Rajca, Rôle du microbiote au cours des maladies inflammatoires intestinales: connaissances actuelles et perspectives, Lettre Hépatogastr, issue.4, pp.148-153, 2011.

R. B. Sartor and G. D. Wu, Roles for intestinal bacteria,viruses, and fungi in pathogenesis of inflammatory bowel disease and therapeutic approaches, Gastroenterology, vol.152, pp.327-366, 2017.

D. Rapozo, C. Bernardazzi, D. Sousa, and H. , Diet and microbiota in inflammatory bowel disease: The gut in disharmony, World J Gastroenterol, vol.23, pp.2124-2164, 2017.

F. Sommer, J. M. Anderson, and R. Bharti, The resilience of the intestinal microbiota influences health and disease, Nat rev Microbial, vol.15, pp.630-638, 2017.

E. Michaud, R. Gayet, and S. Paul, Les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI): qui dit MICI dit dysbiose La lettre de l'hépato-gastroentérologue.Vol XXI-n°1-janvier février, 2018.

R. Ungaro, Antibiotiques associated with increased risk of new-onset Crohn's disease but not ulcerative colitis: a meta-analysis, Am J gastroenterol, vol.109, issue.11, pp.1728-1766, 2014.

M. P. Kronman, Antibiotic exposer and IBD development among children: a population -based cohorte study, Pediatrics, vol.130, issue.4, pp.794-803, 2012.
DOI : 10.1542/peds.2011-3886

K. Naidoo, M. Gordon, and A. O. Fagbemi, Les probiotiques pour le maintien de la rémission dans la colite ulcéreuse

M. Girardin and J. L. Frossard, Place des probiotiques dans le traitement des maladies inflammatoires intestinales, Rev Med Suisse, vol.8, pp.1674-1678, 2012.

, Rectocolite hémorragique évolutive. Recommandations HAS, 2017.

M. Ganji-arjenaki-m,-rafieian-kopaei, Probiotics are a good choice in remission of inflammatory bowel diseases: A meta analysis and systematic review, J Cell Physiol, vol.233, pp.2091-103, 2018.

M. Girardin and J. L. Frossard, Place des probiotiques dans le traitement des maladies inflammatoires intestinales, Rev Med Suisse, vol.8, pp.1674-1678, 2012.

C. Zallot, Transplantation de microbiote fécal et pathologies digestives. La lettre de l'Hépato-gastroentérologue

V. E. Rolfe, P. J. Fortun, and C. J. Hawkey, Bath-Hextall FJ. Probiotics for maintenance of remission in Crohn's disease

. Cochrane, , 2006.

C. Weerth, Intestinal Microbiota of infants with Colic: development and Specific Signatures, Pediatrics, vol.131, pp.550-558, 2013.

A. Schreck-bird, P. J. Gregory, and M. A. Jalloh, Probiotics for te treatment of Intestinal Colic: A Systematic Review

, J Pharm Pract, vol.30, issue.3, pp.366-74, 2017.

, Intérêt des probiotiques dans le traitement de l'infection à Helicobacter pylori : revue de la littérature, Kimmel R

T. Médecine and U. Lorraine, , 2018.

, Cancer colorectal : 18 000 décès par an, Santé publique France. Février, 2018.

. Accueil-presse,

Y. N. Yu and J. Y. Fang, Gut Microbiota and Colorectal Cancer. Gastrointest Tumors, vol.2, pp.26-32, 2015.

I. Sobhani, J. Tap, and F. Roudot-thoraval, Microbial dysbiosis in colorectal cancer patients, PLoS ONE, vol.6, p.16393, 2011.

M. Van-doorn-schepens, D. Budding, and A. Eck, Gut microbiota in diverticulosis; looking for signs of an inflammatory precurosr stage of diverticulitis, 2015.

, Prise en charge médicale et chirurgicale de la diverticulite colique.HAS.TEXTE DES RECOMMANDATIONS Novembre, 2017.

, Troubles féminins et probiotiques : l'intérêt des probiotiques dans le traitement de la vaginose bactérienne et de la vaginite à candida, 2017.

H. Y. Xie, D. Feng, D. M. Wei, and L. Mei, Probiotiques pour le traitement de la candidose vulvo-vaginale chez les femmes non enceintes, 2017.

E. Pericolini, E. Gabrielli, and N. Ballet, Therapeutic activity of a Saccharomyces cerevisiae-based probiotic and inactivated whole yeast on vaginal candidiasis, vol.8, pp.74-90, 2017.

, La place des probiotiques dans le traitement des vaginoses bactériennes. Chaix A. Thèse Pharmacie.Université Lyon, vol.1, 2016.

, Intérêt de l'utilisation des probiotiques dans la prise en charge des vulvovaginites récidivantes. Guéry C. Thèse Médecine, 2017.

A. C. Senok, H. Verstraelen, M. Temmerman, and G. A. Botta, Probiotics for the treatment of bacterial vaginosis

, Cochrane Database of Systematic Reviews, 2009.

C. Collège, . Des, . Et, and . Français, Extrait des Mises à jour en Gynécologie Médicale, 2007.

R. Russo, A. Edu, D. Seta, and F. , Study on the effects of an oral lactobacilli and lactoferrin complex in women with intermediate vaginal microbiota, Arch Gynecol Obstet, 2018.

A. Mitra, The vaginal microbiota,human papillomavirus infection and cervical intraepithelial neoplasia: what do we know and where are we going next? Microbiome, vol.4, p.58, 2016.

K. Kero, Association of asymptomatic bacterial vaginosis with persistence of female genital human papillomavirus infection, Euro J Clin Microbial Infect Dis, vol.36, pp.2215-2219, 2017.

D. Castro-sobrinho and J. M. , Bacterial vaginosis and inflammatory response showed association with severity of cervical neoplasia in HPV-positive women, Diag Cytopathol, vol.44, pp.80-86, 2016.

A. Mitra, D. A. Macintyre, and Y. S. Lee, Cervical intraepithelial neoplasia disease progression is associated with increased vaginal microbiome diversity, Sci Rep, vol.5, p.16865, 2015.

V. Verhoeven, R. N. Makar, and A. , Probiotics enhance the clearance of human papillomavirus-related cervical lesions: a prospective controlled pilot study, Eur j Cancer Prev, vol.22, pp.46-51, 2013.

E. M. Schwenger, A. M. Tejani, and P. S. Loewen, Probiotics for preventing urinary tract infections in adults and children

, Cochrane Database of Systematic Reviews, 2015.

L. Hanson, L. Vandevusse, and M. Jermé, Probiotics for Treatment and Prevention of Urogenital Infections in Women: A Systematic Review. J Midwifery Womens Health, vol.61, pp.339-55, 2016.

. Obepi, Enquête épidémiologique nationale sur le surpoids et l'obésité, 2012.

A. Oussalah, Microbiote intestinal et dysfonction métabolique. La lettre de l'hépatogastroentérologue, vol XXI, pp.1-28, 2018.

K. E. Bouter, D. H. Van-raalte, and A. K. Groen, Role of the gut microbiome in the pathogenesis of obesity and obesity-related metabolic dysfunction, Gastroenterology, vol.152, pp.1671-1679, 2017.

P. Turnbaugh, M. Hamady, and T. Yatsunenko, A core gut microbiome in obese and lean twins. nature, vol.457, pp.480-484

K. Clément, Le microbiote intestinal: un nouvel acteur de la nutrition? Cah Nutr Diététique, Déc, vol.50, issue.6, 2015.

P. Gerard, Gut microbiota and obesity, Cell Mol Life Sci, 2015.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01532527

. Thalss-c, D. Zeev, and M. Levy, Transkingdom control of microbiota diurnal oscillations promotes metabolic homeostasis, Cell, vol.159, issue.3, pp.514-543, 2014.

C. C. Evans, Excercice Prevents Weight Gain and Alters the Gut Microbiota in a mouse model of High Fat Diet-induced Obesity, PLoS ONE, vol.9, pp.631913-631933, 2014.

M. Estaki, Cardiorespiratory fitness as a predictor of intestinal microbial diversity and distinct metagenomic functions, Microbiome, vol.4, 2016.

. Bailey, Association of antibiotics in infancy with early childhood obesity, JAMA. pediatric, vol.168, issue.11, pp.1063-1069, 2014.

A. Mor, Prénatal exposer to sytemic antibacterials and overweignt and obesity in Danish schoolchildren: a prévalence sut, Int J Obes, vol.39, issue.10, pp.1450-55, 2015.

N. T. Mueller, Prenatal exposure to antibiotics, cesarean section and risk of childhood obesity, Int J Obes (Lond), vol.39, pp.665-70, 2015.

B. S. Schwartz, J. Pollak, and L. Bailey-davis, Antibiotic use and childhood body mass index trajectory, Int j Obes, 2015.

M. B. Azad, S. L. Bridgman, A. B. Becker, and A. L. Kozyrskyj, Infant antibiotic exposure and the development of childhood overweight and central adiposity, Int J Obes, vol.38, pp.1290-1298, 2014.

, Exposition aux antibiotiques et risque d'obésité : revue systématique de la littérature, Bottolier Curtet L, Server A, 2017.

V. K. Ridaura, J. J. Ray, and F. E. , Gut microbiota from twins discordant for obesity modulate metabolism in mice, Science, vol.341, issue.6150, p.12411214, 20136.

P. J. Turnbaugh, R. E. Ley, and M. A. Mahowald, An obesity-associated gut microbiome with increase capacity for energy harvest, Nature, vol.444, issue.7122, pp.1027-1058, 2006.

C. P. Hong, Gut-specific Delivery of T-helper 17 cells reduces obesity and insulin resistance in mice

, Gastroenterology, vol.poi, issue.17, pp.30180-30184, 2017.

P. J. Turnbaugh, V. K. Ridaura, and J. J. Faith, The effect of diet on the human gut microbiome: a metagenomic analysis in humanized gnotobiotic mice, Sci Transl Med, issue.6, pp.6-14, 2009.

N. J. Kellow, M. T. Coughlan, and C. M. Reid, Metabolic benefits of dietary probiotics in human subjects: a systematic review of randomized controlled trials, Br J Nutr, vol.111, issue.7, pp.1147-61, 2014.

, Diabète de type 1 et microbiote : les cellules MAIT comme biomarqueur et nouvelle cible thérapeutique. Octobre 2017. citant Rouxel O et al. Cytotoxic and regulatory role of mucosal-associated invariant T cells in type 1 diabetes, Nature Immunology

X. Wang, N. Ota, and . Manzanillo-p, Interleulin-22 alleviates metabolic disorders and restores mucosal immunity in diabetes; nature, vol.514, pp.237-278, 2009.

. Pd, J. Amar, and M. A. Iglesias, Metabolic endotoxemia initiates obesity and insulin resistance, Diabetes, vol.56, issue.7, pp.1761-72, 2007.

J. Amar, R. Burcelin, and J. B. Ruidavets, Energy intake is associated with endotoxemia in apparently healthy men

, Am J Clin Nutr, vol.87, issue.5, pp.1219-1242, 2008.

X. Wu, C. Ma, and L. Han, Molecular characterisation of the faecal microbiota in patients with type II diabetes

, Curr Microbiol, vol.61, issue.1, pp.69-78, 2010.

N. R. Shin, J. C. Lee, and H. Y. Lee, an increase in Akkermansia spp. population induced by metformin treatment improves glucose homeostasis in diet-induced obese mice, Gut, vol.63, pp.727-762, 2014.

J. Qin, Y. Li, and Z. Cai, A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes, Nature, vol.490, pp.55-60, 2012.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204262

S. Bruley-de-varannes, Microbiote et syndrome de l'intestin irritable. Rev du microbiote. 016, vol.6, pp.4-10

D. J. Martino, Relationship between early intestinal colonization, mucosal immunoglobulin A production and systemic immune development, Clin Exper allergy, vol.3007, pp.69-78

S. Nicolas, Impact du microbiote intestinal sur le développement des allergies, Rev Fr Allegro. Avr, vol.56, issue.3, 2016.

Y. M. Sjogren, M. C. Jenmalm, and M. F. Bottcher, Altered early infant gut microbiota in children developing allergy up to 5 years of age, Clin Exp Allergy, vol.39, issue.4, pp.518-544, 2009.

T. R. Abrahamsson, E. Jakobsson, and A. F. Andersson, Low diversity of the gut microbiota in infants with atopic eczema

, J Allergy Clin Immunol, vol.129, pp.434-474, 2012.

A. Shreiner, G. B. Huffnagle, and M. C. Noverr, The « microflora hypothesis » of allergic disease, Adv Exp Med Biol, 2008.

B. I. Nwaru, H. M. Takkinen, and M. Kaila, Food diversity in infancy and the risk of childhood asthma and alllergies, J Allergy Clin Immunol, vol.133, pp.1084-1091, 2014.

V. Mutius and E. , Etudier les interactions entre le microbiote environnemental et les microbiotes humains. rev du microbiote, Juin, vol.5, pp.17-19, 2016.

H. Bisgaard, N. Li, and K. Bonnelykke, Reduced diversity of the intestinal microbiota during infancy is associated with increased risk of allergic disease at school age, J Allergy Clin immune, vol.128, issue.3, pp.646-52, 2011.

M. M. Zaiss, The Intestinal Microbiota Contributes to the Ability of Helminths to Modulate Allergic Inflammation, Immunity, vol.43, pp.998-1010, 2015.

N. B. Rutten, C. B. Rijkers, and R. G. Meijssen, Intestinal microbiota composition after antibiotic treatment in early life: the INCA study, BMC Pediatric, vol.15, p.204, 2015.

B. Lapin, J. Piorkowski, and D. Ownby, Relationship between prenatal antibiotic use and asthma in at-risk children, Ann Allergy asthma immunol, vol.114, issue.3, pp.203-210, 1998.

N. Elazab, A. Mendy, and J. Gasana, Probiotic Administration in Early Life Atopy, and Asthma: A Meta-analysis of, Clinical Trials. PEDIACTRICS, vol.132, issue.3, pp.666-676, 2013.

E. Draaisma, A multinational study to compare prevalence of atopic dermatitis in the first year of life

, Pediatric Allerg Immunol, vol.26, pp.359-66, 2015.

, Etude épidémiologique nationale menée par la société française de dermatologie : « Objectifs Peau, 2017.

D. Belilovsky, C. Bohbot, and J. M. , Microbiotes, peau, dermatite atopique et psoriasis. Rev du microbiote, vol.7, pp.4-10, 2017.

C. A. Cuello-garcia, J. L. Brozek, and A. Fiocci, Probiotics for the prevention of allergy: A systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials, J Allergy Clin Immunol, vol.136, issue.4, pp.952-61, 2015.

M. Kalliomaki, Probiotics in primary prevention of atopic disease: a randomised placebo-controlled trial, Lancet, vol.357, pp.1076-1085, 2001.

M. Kalliomaki, Probiotics and prévention atopic disease: 4 years follow-up of randomized placebocontrolled trial, Lancet, vol.361, pp.1869-71, 2003.

A. L. Taylor, J. A. Dunstan, and S. L. Prescott, Probiotic supplementation for the first 6 months of life fails to reduce the risk of atopic dermatitis and increases the risk of allergen sensitization in high-risk children: a randomized controlled trial, J allergy Clin immune, vol.119, pp.184-91, 2007.

F. J. Bath-hextall, C. Jenkinson, R. Humphreys, and H. C. Williams, Dietary supplements for established atopic eczema

, Cochrane Database of Systematic Reviews, 2012.

M. Viljanen, Probiotics in the treatment of atopic eczeam/dematitis syndrome in infants: a double-blind placebo-controlled trial, Allergy, vol.60, pp.494-500, 2005.

A. Fiocchi, World Allergy Organization-Mc Master university Guidelines for Allergic Disease Prevention, Probiotics. World Allergy Organ J, vol.8, p.4, 2015.

M. Hilty, C. Burke, and H. Pedro, Disordered Microbial Communities in asthmatic Airways, Neyrolles O, PLoS ONE, vol.5, issue.1, p.8578, 2010.

Y. J. Huang, S. Nariya, and J. M. Harris, The airway microbiome in patients with severe asthma: Associations with disease features and severity

, J Allergy Clin immune, vol.136, issue.4, pp.874-84, 2015.

P. R. Marri, D. A. Stern, and A. L. Wright, Asthma-associated differences in microbial composition of induced sputum, J Allergy Clin immunol, vol.131, pp.346-52, 2013.

E. Hol-j,van-leer, E. Schuurman, and B. , The acquisition of tolerance toward cow's milk through probiotic supplementation: a randomized, controlled trail, J Allergy Clin Immunol, vol.121, pp.1448-54, 2008.

B. Canari, R. Sangwan, N. Stefka, and A. T. , Lactobacillius rhamnosus GG-supplemented formula expands butyrate-producing bacterial strains in food allergic infants, ISME J, vol.1010, pp.742-50, 2016.

V. D. Felice, Microbiota-gut brain signalling in Parkinson's disease: implications for non-motor symptoms. Parkinsonism and Related Disorders, vol.27, pp.1-8, 2016.

J. F. Cryan and T. G. Dinan, Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour, Nat rev Neurosci, vol.13, issue.10, pp.701-713, 2012.

H. Tremlett, D. Fadrosh, and . Lynch-s, Gut microbiome in early pediatric multiple sclerosis: a case control study ECTRIMS, 2015.

G. Fond, G. Chevalier, and G. Eberl, Le rôle potentiel du microbiote intestinal dans les troubles psychiatriques majeurs: mécanismes, données fondamentales, co-morbidités gastro-intestinales et options thérapeutiques. Presse Médcale, Janv, 2016.

M. De-angelis, M. Piccolo, and L. Vannini, Fecal microbiote and metabolome of children with autism and pervasive developmental disorder not otherwise specified, PLoS One, vol.8, issue.10, p.76993, 2009.

A. Partty, M. Kalliomaki, and . Wacklin-p, A possible link between early probiotic intervention and the risk of neuropsychiatric disorders later in childhood: a randomized trial, Pediatric research, vol.77, pp.823-831, 2015.

F. De-filippis, N. Pellegrini, and L. Vannini, High-level adherence to a Mediterrannean diet beneficially impacts the gut microbiote and associated metabolome, Gut, 2015.

R. Estruch, R. E. Salas-salvado, and J. , Primary prevention of cardiovascular disease with a Mediterranean diet

, N Engl J Med, vol.368, pp.1279-90, 2013.

Z. Wang, E. Klipfell, and B. J. Bennett, Gut flora metabolism of phosphatidylcholine promotes cardiovascular disease, Nature, vol.7, issue.7341, pp.57-63, 2011.

F. Carbonnel, Microbiote intestinal et traitement des cancers. Rev des microbiotes, vol.10, p.4, 2018.

A. Viviane, F. Aegerter, and . Bally, Prévention et traitement des diarrhées dues aux antibiotiques : rôle des probiotiques, Revue Médicale Suisse, vol.8, 1907.

, Quelle représentation avez vous des probiotiques ? 2/ Voici une liste non exhaustive des probiotiques existant en pharmacie en France

, Quelle réaction avez vous à la lecture de cette liste ? 3/ En prescrivez vous? Si oui: dans quelles indications? Est ce une prescription systématique? Quelle est votre attitude si un patient vous en demande? 4/ Avez vous des patients demandeurs?

, Quels bénéfices en attendez vous quand vous en prescrivez? Avez vous des craintes à en prescrire? 6/ Quelles sont vos sources de connaissances sur le sujet (revues, congrès?

, Avez vous la notion de recommandations dans ce domaine? 7/ Lecture de la fiche de synthèse

, Quelle remarques vous viennent à l'esprit en lisant cette fiche?

N. Amm, L. Confort-®-(l.-plantarum, B. Gg, L. Longum, B. Acidophilus et al., CA -CARBOLEVURE ® ( Saccharomyces cerevisiae 10^8 germes/gramme, charbon activé, LISTE (non exhaustive) des Probiotiques vendus en pharmacie, en France : Lexique : > AMM: Autorisation de mise sur le marché (AMM) = médicament > CA : complément alimentaire > NR : non remboursé > UFC: unité formant colonies PROBIOTIQUE à visée DIGESTIVE Adulte et enfant : -BACILOR ® ( Lactobacillus casei var rhamnosus 10^8-9 germes/gélule ) : AMM, NR -BIOGAIA PRO TECTIS ® (L. reuteri protectis DSM 17938 10^8 UFC/j ) : CA -BIOPROTUS VOYAGE ® (Saccharomyces boulardii, Bifidobacterium lactis, L. acidophilius: 10^9 germes/gélule , inuline), vol.2