Caractérisation de QTL contrôlant des traits racinaires chez le Mil - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2020

Characterization of QTLs controlling root traits in Pearl millet

Caractérisation de QTL contrôlant des traits racinaires chez le Mil

Résumé

Pearl millet, Pennisetum glaucum, is the staple food of more than 90 million people in sub-Saharan Africa and India, and global millet production is limited by the drought and low soil fertility that characterize its growing area. Improving its root system could help optimize the acquisition of water and mineral elements. Knowledge of the genetic basis that controls the establishment of this root system may allow the use of marker-assisted selection, a powerful tool that fixes the selection on the selected traits. The study of the root architecture and root growth dynamics of millet has made it possible to highlight certain root traits of interest: early growth of the seminal root and rhizospheric soil aggregation. Preliminary studies led to the detection of several QTLs controlling these traits by association genetics. The objective of this training course was to validate these QTLs using two types of population coming from crosses between two contrasted parents. We first tested 4 methods for QTL detection using bulk segregant analysis. Simulations were conducted to evaluate the impact of the QTL effect and number of individuals on QTL detection accuracy on these methods. Beside, we initiated the characterization of a population of backcross inbred lines (BC2F4). We evaluated the homogeneity of a sample of BC2F4 lines using genotypic and phenotypic methods. We observed inter-linear heterogeneity and intra-linear homogeneity. This work will help detect QTLs of interest.
Le mil, Pennisetum glaucum, constitue l’aliment de base de plus de 90 millions de personnes en Afrique sub-saharienne et en Inde. La production mondiale de mil est limitée par la sécheresse et une faible fertilité des sols qui caractérisent sa zone de culture. L'amélioration de son système racinaire pourrait contribuer à optimiser l'acquisition de l'eau et des éléments minéraux. La connaissance de la base génétique qui contrôle l'établissement de ce système racinaire peut permettre l'utilisation de la sélection assistée par marqueurs, un puissant outil qui fixe la sélection sur les traits sélectionnés. L’étude de l’architecture racinaire et de la dynamique de croissance racinaire du mil a permis de mettre en évidence certains traits racinaires d’intérêt : la croissance précoce de la racine séminale et l'agrégation du sol rhizosphérique. Des études préliminaires ont abouti à la détection de plusieurs QTL contrôlant ces traits par génétique d’association. L’objectif de ce stage était de valider ces QTL d’intérêt en utilisant des populations obtenues à partir de deux parents présentant les caractères contrastés. Nous avons tout d’abord comparé l’efficacité de quatre méthodes de détection de QTL à partir d’une analyse de ségrégation en masse. Une étude de simulation a été réalisée pour évaluer l’effet de la variation de l’effet du QTL et du nombre d’individus sur la précision de détection de QTL pour ces différentes méthodes. Par ailleurs, nous avons initié la caractérisation d’une population de lignées recombinantes fixées (BC2F4) en évaluant l’homogénéité d’un échantillon de lignées par génotypage et phénotypage. Ces travaux contribueront à la détection de QTL d’intérêt.
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

dumas-03032947 , version 1 (01-12-2020)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-03032947 , version 1

Citer

Princia Aurore Biawallys Nakombo-Gbassault. Caractérisation de QTL contrôlant des traits racinaires chez le Mil. Agronomie. 2020. ⟨dumas-03032947⟩
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