Pronostic de l'infiltrat inflammatoire dans les cancers du sein triple-négatifs (PRINCESSE) : constitution d'une signature transcriptomique pronostique liée à l'inflammation - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2021

Prognostic value of the immune infiltrate in triple-negative breast cancer patients with residual disease after neoadjuvant chemotherapy

Pronostic de l'infiltrat inflammatoire dans les cancers du sein triple-négatifs (PRINCESSE) : constitution d'une signature transcriptomique pronostique liée à l'inflammation

Résumé

Purpose: triple-negative breast cancer (TNBC) patients have up to 75% risk of metastatic relapse within the following years when they have residual disease (RD) after neo-adjuvant chemotherapy (NACT). The immune infiltrate in TNBC being prognostic and predictive of response to treatment, we sought to develop an immunologic transcriptomic signature to better predict relapse in these patients. Experimental design: We identified 115 samples of residual tumors from post-NACT TNBC patients. We profiled the expression of 770 genes related to cancer microenvironment using the Nanostring PanCancer IO360 panel to develop a prognostic transcriptomic signature, and describe the immune microenvironment of the residual tumor. Results: thirty-eight (33%) of patients experienced metastatic relapse. Hierarchical clustering separated patients into 5 clusters with distinct prognosis, based on pathways linked to immune activation, epithelial to mesenchymal transition and cell cycle. The immune microenvironment of the residual disease was significantly different between patients who experienced relapse compared to those who did not, the latter having significantly more effector anti-tumoral immune cells, with significant differences in lymphoid subpopulations. We selected eight genes linked to immunity (BLK, GZMM, CXCR6, LILRA1, SPIB, CCL4, CXCR4, SLAMF7) to develop a transcriptomic signature which could predict relapse in our cohort and in the RCB2 subgroup. This signature was validated in two external cohorts (KMplot and METABRIC). Conclusions: lack of immune activation after NACT appears to be a strong prognostic factor for metastatic relapse. We propose a prognostic signature based on immune infiltrate that could lead to targeted therapeutic strategies to improve patients’ prognosis.
Objectif : les patientes avec un cancer du sein triple-négatif (CSTN) ayant un résidu tumoral après chimiothérapie néo-adjuvante ont jusqu’à 75% de risque de rechute métastatique dans les années qui suivent la prise en charge initiale. L’infiltrat immunitaire des CSTN ayant été montré comme pronostique et prédictif de la réponse aux traitements, nous avons voulu développer une signature transcriptomique immunologique pour mieux prédire le risque de rechute chez ces patientes. Méthode : nous avons identifié 115 cas de CSTN avec maladie résiduelle post traitement, sur lesquels nous avons testé le panel de 770 gènes liés au microenvironnement tumoral (PanCancer IO360, Nanostring). Nous avons développé une signature transcriptomique et analysé l’infiltrat immunitaire présent dans les tumeurs résiduelles. Résultats : 38 patientes (33%) ont présenté une rechute métastatique. La séparation des patientes via un clustering hiérarchisé identifiait cinq groupes avec des pronostics différents, selon des voies de signalisation liées à l’activation immunitaire, la transition épithéliomésenchymateuse et le cycle cellulaire. Le microenvironnement immunitaire était significativement différent entre les patientes qui présentaient secondairement une rechute et celles qui ne rechutaient pas, les dernières ayant plus de cellules effectrices anti-tumorales lymphocytaires. Nous avons développé une signature de huit gènes liés à l’immunité (BLK, GZMM, CXCR6, LILRA1, SPIB, CCL4, CXCR4, SLAMF7) qui prédit le risque de rechute dans notre cohorte et en particulier dans le sous-groupe de patientes RCBII. Cette signature était également pronostique dans deux cohortes indépendantes (KMplot et METABRIC). Conclusion : l’absence d’activation immunitaire après chimiothérapie néo-adjuvante est lié à un haut risque de rechute métastatique. Nous proposons une signature transcriptomique pronostique liée à l’immunité qui pourrait permettre une meilleur identification et prise en charge des patientes.
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Dates et versions

dumas-03376597 , version 1 (13-10-2021)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-03376597 , version 1

Citer

Céline Blaye. Pronostic de l'infiltrat inflammatoire dans les cancers du sein triple-négatifs (PRINCESSE) : constitution d'une signature transcriptomique pronostique liée à l'inflammation. Sciences du Vivant [q-bio]. 2021. ⟨dumas-03376597⟩
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