Emergence des entérobactéries Escherichia coli productrices des carbapénèmases NDM-5 et OXA-181 à la Réunion - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2022

Emergence of NDM-5 and OXA-181 carbapenemase-producing Enterobacteriaceae Escherichia coli in La Reunion

Emergence des entérobactéries Escherichia coli productrices des carbapénèmases NDM-5 et OXA-181 à la Réunion

Thibaut Vedani
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1134065

Résumé

In Reunion island, the number of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae rises each year with a predominance since 2015-2016 of the NDM-5 and OXA-181 beta-lactamases from the Escherichia coli species. After having established the final epidemiologic assessment of the EPC in La Reunion from January 2010 to December 2020, we have selected all clinical isolates of NDM-5 and OXA-181-producing E. coli from La Reunion and Mayotte for the analysis of their phenotypical resistance and genetic proximity. In La Reunion, 33 (i.e. 87%) and 17 (i.e. 100%) of patients carrying NDM-5 and OXA-181-carbapenemase-producing bacteria went abroad mainly in Mayotte, Comoros and Madagascar. The analysis of the NDM-5 strains showed an almost complete resistance against the beta-lactams, including the aztreonam. Furthermore, the susceptibility of aztreonam was restored for 72% (n = 41/57) of the strains when combined with clavulanic acid and for 75% (n = 43/57) of the strains when combined with avibactam. For the OXA-181, the susceptibility to beta-lactams was found to be more varying with a good efficacy to the ceftazidime-avibactam. The genotypical analysis confirmed the existence of many epidemic clones among clonal group such as ST-58, ST-167, ST-405 and ST-410. In La Reunion, the impact of the NDM-5 and OXA-181 E. coli strains coming mainly via importations from outside La Reunion has been rising. More particularly, some STs have been found to be preferentially associated to certain areas in the Southwest Indian Ocean and notably in the Comoros Archipelago and Madagascar. This emergence raises concern about the implantation of this kind of EPC in the hospitals and communities in La Reunion.
Il existe chaque année à La Réunion une augmentation des entérobactéries productrices de carbapénèmases (EPC) avec une prédominance depuis 2015-2016 des bêta-lactamases NDM-5 et OXA-181 chez l'espèce Escherichia coli. Après avoir établi le bilan épidémiologique des EPC à La Réunion de janvier 2010 à décembre 2020, nous avons sélectionné l'ensemble des souches E. coli NDM-5 et OXA 181 de La Réunion et de Mayotte pour analyser les résistances phénotypiques mais aussi leur proximité génétique. À La Réunion, 33 (soit 87%) et 17 (soit 100%) patients porteurs respectivement de E. coli NDM-5 et OXA-181 avaient un lien avec l'étranger, principalement de Mayotte, des Comores et de Madagascar. L'analyse phénotypique des souches NDM-5 a montré une résistance quasi-totale à toutes les bêta-lactamines, y compris l'aztréonam. La sensibilité à l'aztréonam a été restaurée pour 72% (n = 41/57) et 75% (n = 43/57) des souches lorsque ce dernier était combiné respectivement à l'acide clavulanique et à l'avibactam. Pour les OXA-181, la sensibilité aux bêta-lactamines était plus variable avec une bonne efficacité de la ceftazidime-avibactam. L'analyse génotypique a confirmé l'existence de nombreux clones épidémiques au sein de groupes clonaux tels que ST-58, ST-167, ST-405 et ST-410. Il existe à La Réunion une augmentation de l'incidence des souches E. coli NDM-5 et OXA-181 issues pour la majorité d'importations et dont certains STs sont associés préférentiellement à certaines régions du Sud-Ouest de l'océan Indien notamment de l'archipel des Comores et de Madagascar. Cette émergence fait craindre l'implantation de ce type d'EPC dans le secteur hospitalier et communautaire de La Réunion.
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samedi 20 avril 2024
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Dates et versions

dumas-03662050 , version 1 (09-05-2022)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-03662050 , version 1

Citer

Thibaut Vedani. Emergence des entérobactéries Escherichia coli productrices des carbapénèmases NDM-5 et OXA-181 à la Réunion. Sciences du Vivant [q-bio]. 2022. ⟨dumas-03662050⟩
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