Identification of target traits in the field and study of the plasticity of the proteome in the early cold response of maize
Étude de la plasticité du protéome en fonction de la diversité des réponses du maïs au froid précoce
Résumé
Cold conditions during the early stages of maize development hinder its growth. The objective of this study is to identify the traits to target for assessing maize cold sensitivity in the field, as well as to determine elements of the proteome that might be differentially expressed based on genotype tolerance. Phenotypic, metabolite, and protein assay data were employed, originating from a diverse panel of 27 dent corn genotypes crossed with a flint tester, planted in the field at two different sowing dates. Classification of genotypes according to their sensitivity is achievable using both phenotypic and carbon metabolism data. Key areas to focus on include final leaf dimensions, total leaf count, assessment of senescence at various stages, as well as starch and glucose quantification. Utilizing clustering results reveals proteome modifications under cold stress in the most sensitive genotypes. This proteome is constrained and exhibits numerous partial correlations among proteins involved in carbon metabolism.
Des conditions froides lors des premiers stades de développement du maïs retardent son développement. Ce mémoire a pour objectif d’identifier les caractères à cibler pour évaluer la sensibilité au froid du maïs au champ, ainsi que de déterminer des éléments du protéome susceptible d’être différentiellement exprimé selon la tolérance d’un génotype. Des données de phénotypage, de dosages de métabolites et de protéines ont été utilisées. Elles sont issues d’un panel de diversité de 27 génotypes dentés croisés avec un testeur corné, mis au champ à deux dates de semis différentes. Une classification des génotypes selon leur sensibilité est possible à partir des données phénotypiques et métabolisme carboné. Les dimensions finales des feuilles, le nombre de feuilles total, l’évaluation de la sénescence à différents stades, ainsi que le dosage d’amidon et de glucose soient des pistes à privilégier. L’utilisation des résultats de clustering révèlent la modification du protéome par un stress froid chez les génotypes les plus sensibles. Il est contraint et exprime de nombreuses corrélations partielles entre protéines impliquées dans le métabolisme carboné.