Intérêt de la protéomique pour l'identification de marqueurs diagnostiques d'accommodation en greffe rénale - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2014

Urinary proteomics for the detection of accommodation diagnostic biomarkers in kidney transplantation

Intérêt de la protéomique pour l'identification de marqueurs diagnostiques d'accommodation en greffe rénale

Thomas Jouve
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 961489

Résumé

The prognostic of kidney transplantation is still limited by antibody mediated rejection (ABMR). Donor-specific antibodies are implicated in ABMR. However, accommodation is encountered, in which antibodies do not induce graft dysfunction. This work is focused on the detection of urinary protein biomarkers of accommodation in kidney transplantation. All kidney transplant recipients followed at Grenoble University Hospital and submitted to transplant biopsy between october 2011 and may 2014 were included in this study. SELDI-TOF mass-spectrometry analysis was performed on a urine sample to detect differential biomarkers between accommodation and ABMR cases. A decision tree classifier was built on all significantly differentially expressed urinary proteins, using univariate tests. 250 patients provided a urine sample and a graft biopsy. Comparison of protein peaks between groups showed a differential peak at mass 7,52kDa. The associated classifier showed a sensitivity of 100% and a specificity of 91%, corresponding to a positive predictive value of 89% and negative predictive value of 100%. Urinary proteomic analysis allowed detection of a non-invasive protein biomarker enabling the diagnosis of accommodation. These results should be validated on an external validation set. This cohort will be prospectively followed to detect and identify prognostic biomarkers of accommodation. This would enable an early and optimal care of rejecting patients.
Le rejet humoral chronique représente une cause de dysfonction du greffon médiée par la présence d'anticorps dirigés contre le greffon. Toutefois, des états d'accommodation sont décrits, correspondant à un état où les anticorps dirigés contre le greffon ne sont pas toxiques. Le travail réalisé ici consiste à mettre en évidence des marqueurs protéiques urinaires d’accommodation en transplantation rénale. L’ensemble des patients greffés rénaux suivis au CHU Grenoble et ayant bénéficié d’une biopsie entre octobre 2011 et mai 2014 ont été inclus dans l’étude (n=250). Une analyse spectrométrique SELDI-TOF a été réalisée sur l’urine afin de rechercher des marqueurs différentiels entre le groupe des patients "accommodants" et le groupe des patients « rejeteurs ». Un classifieur basé sur des arbres de décision a été construit sur l’ensemble des variables différentiellement exprimées en tests univariés. La comparaison des pics protéiques entre les 2 groupes « accomodants » versus « rejeteurs » a permis de mettre en évidence un pic protéique différentiel de masse 7,52 kDa. Le classifieur ainsi construit permet d’obtenir une sensibilité de 100% et une spécificité de 91%, soit une valeur prédictive positive de 89% et négative de 100%. L’analyse protéomique urinaire permet l’identification d’un marqueur protéique permettant le diagnostic d’accommodation, de façon non invasive. Ces résultats devront être validés sur une cohorte externe. La cohorte de patients pourra être suivie de façon prospective afin de mettre en évidence des marqueurs pronostiques d’accommodation, permettant une prise en charge précoce et optimale des patients rejeteurs.
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Dates et versions

dumas-01083385 , version 1 (17-11-2014)

Identifiants

Citer

Thomas Jouve. Intérêt de la protéomique pour l'identification de marqueurs diagnostiques d'accommodation en greffe rénale. Médecine humaine et pathologie. 2014. ⟨dumas-01083385⟩
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