Quantification de la charge allélique des mutations de CALR sur ADN et sur ARN par analyse de fragments - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2014

CALR mutations allelic burden quantification on DNA and RNA by fragments length analysis

Quantification de la charge allélique des mutations de CALR sur ADN et sur ARN par analyse de fragments

Olivier Mansier

Résumé

Les thombocytémies essentielles (TE) et myélofibroses primitives (MFP) sont des syndromes myéloprolifératifs (SMP) dont les mécanismes oncogéniques restent à ce jour incomplètement compris. La découverte des mutations de JAK2 et MPL a permis une avancée dans la compréhension de leur physiopathologie ainsi que leur diagnostic moléculaire. Cependant, ces mutations n’expliquent que 65 et 70% des cas de TE et MFP respectivement. La mise en évidence de mutations du gène codant pour la calréticuline (CALR) au cours de ces 2 maladies a apporté un 3e marqueur moléculaire expliquant plus d’un quart des cas de TE et MFP. À ce jour, la seule technique décrite dans la littérature permettant une quantification de la charge allélique CALR est l’analyse de fragments. Toutefois, ni ses performances, ni son application à la quantification de la charge allélique sur ARN n’ont été décrites. Nous avons adapté notre technique d’analyse de fragments sur ADN à une utilisation sur ARN et comparé les résultats obtenus sur ces 2 matériels. Les charges alléliques mesurées sur ADN et sur ARN sont comparables. Nous avons par ailleurs confirmé l’absence de mutation de CALR au cours des leucémies myéloïdes chroniques, y compris dans les présentations hyperthrombocytaires. La comparaison des charges obtenues par analyse de fragments et par PCR digitale montre une excellente corrélation entre les 2 techniques, prouvant que l’analyse de fragments est une technique adaptée à la quantification des charges alléliques des mutations de CALR.
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Dates et versions

dumas-01108800 , version 1 (23-01-2015)

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  • HAL Id : dumas-01108800 , version 1

Citer

Olivier Mansier. Quantification de la charge allélique des mutations de CALR sur ADN et sur ARN par analyse de fragments. Sciences pharmaceutiques. 2014. ⟨dumas-01108800⟩
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