Étude épidémiologique et moléculaire du Cryspovirus (CSPV-1) dans les espèces de cryptosporidium qui circulent chez l'homme et les ruminants en France - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
Mémoires Année : 2023

Epidemiological and molecular study on Cryspovirus (CSPV-1) in cryptosporidium species circulating in man and ruminants in France

Étude épidémiologique et moléculaire du Cryspovirus (CSPV-1) dans les espèces de cryptosporidium qui circulent chez l'homme et les ruminants en France

Résumé

Cryptosporidioses are parasitic zoonotic diseases that are crucially important in human health as in animal health. They lead to major economic loss in livestock farming. The discovery of a viral symbiont in Cryptosporidium changed the understanding of the parasite's pathogeny and epidemiology completely. Such virus was named Cryspovirus. The purpose of this paper was, after a bibliographie review on the main features of Cryptosporidium and Cryspovirus, to search CSpV-1 in fecal samples collected in the field and to suggest an epidemiological analysis of the clades of Cryspovirus circulating in man and ruminants in France. The experimental work accounted of in this paper led to the execution of multiple PCRs on samples collected in the field in sheep and cow farms and on human samples. The aim was at first to confirm the presence of Cryptosporidium, then to look for viral RNA, and finally to sequence it. It was shown by the experimental work that Cryspovirus is widespread in France among numerous species (human, sheep, cattle). This paper represents the first description of Cryspovirus in Cryptosporidium of human origin in France. The Cryspovirus is an RNA virus that has a very peculiar, vertical-only, transmission mode. Its presence seems to be linked to increased fecundity and infectivity. No mode of action is currently identified; however, it is likely that the virus can activate the interferon gamma signaling way in the mammalian host, which allows the parasite to evade the immune system. During the experiments, we observed an 85% positivity rate to CSpV-1. Further experiments must be carried out with cell culture to precisely quantify the effect of Cryspovirus infection of Cryptosporidium.
Les cryptosporidioses sont des maladies parasitaires zoonotiques d'importance majeure en santé humaine comme en santé animale. Elles sont à l'origine de pertes économiques majeures en élevage. La découverte d'un symbionte viral chez Cryptosporidium, nommé Cryspovirus, a rebattu les cartes de la compréhension de la pathogénie et de l'épidémiologie de ce parasite. L'objet de ce travail était, après une étude bibliographique retraçant les principales caractéristiques de C. parvum et de Cryspovirus, de mettre en évidence la présence de CSpV-1 dans des échantillons de matières fécales recueillis sur le terrain ainsi qu'une analyse épidémiologique des clades de Cryspovirus circulant chez l'homme et les ruminants en France. Ce travail a conduit à la réalisation de plusieurs PCR sur des échantillons collectés sur le terrain dans des élevages ovins et bovins ainsi que sur des échantillons d'origine humaine fournis par le Centre national de référence des cryptosporidies du CHU de Rouen. L'objectif était dans un premier temps de confirmer la présence d'une cryptosporidie dans l'échantillon puis de tester la présence des ARN viraux et enfin de les séquencer. Nous avons montré que le Cryspovirus est très répandu parmi les lignées de cryptosporidies en France, et ce dans plusieurs espèces (humain, ovin, bovin). Il s'agit de la première description du Cryspovirus en France dans des lignées de Cryptosporidium isolées chez l'être humain. Ce Cryspovirus est un virus à ARN qui présente un mode de transmission tout à fait original, par voie verticale exclusivement. La présence de ce virus dans les cryptosporidies semble être à l'origine d'une fécondité et d'une infectiosité majorée, sans que le mode d'action précis ne soit pour l'instant clairement identifié. L'hypothèse la plus probable est une action du virus sur la voie de l'interféron gamma chez l'hôte mammifère qui permet au parasite d'échapper au système immunitaire. La prévalence observée de CSpV-1 au cours des manipulations était de près de 85% toutes espèces confondues. De nouvelles expériences doivent maintenant être entreprises sur cultures cellulaires afin de quantifier précisément l'effet de l'infection de Cryptosporidium par Cryspovirus.
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Étienne Carvin. Étude épidémiologique et moléculaire du Cryspovirus (CSPV-1) dans les espèces de cryptosporidium qui circulent chez l'homme et les ruminants en France. Médecine vétérinaire et santé animale. 2023. ⟨dumas-04415135⟩
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