Les phénylpropanoïdes sont des métabolites secondaires accumulés dans de nombreuses espèces végétales. La voie de biosynthèse des phénylpropanoïdes aboutit notamment à la formation des lignines, ainsi que des lignanes et des flavonoïdes. Chez le lin (Linum usitatissimum), espèce agronomique d’intérêt régional, ces derniers composés sont accumulés en quantité importante dans la graine. Un intérêt particulier est porté à ces composés pour les propriétés biologiques qu’ils présentent en termes de santé humaine et de nutrition. Cependant leur rôle in planta n’est actuellement pas clairement défini. Les connaissances acquises sur la voie de biosynthèse des phénylpropanoïdes et des lignanes permettent de produire des plantes transgéniques inhibant ou surexprimant certains gènes d’intérêt dans le but de comprendre les mécanismes de régulation de ces voies ainsi que leur impact sur l’ensemble de la plante. Le travail présenté porte sur l’étude métabolomique par RMN 1H de graines issues de plantes transgéniques : certaines surexprimant le gène codant pour la férulate-5-hydroxylase, d’autres inhibant le gène codant pour la pinorésinol-laricirésinol-réductase. Dans les deux cas, une diminution de la biosynthèse du sécoisolaricirésinol diglucoside (SDG), principal lignane accumulé dans la graine de lin, est observée. Un impact sur l’ensemble du métabolome est également observé. Ces résultats permettent de poser différentes hypothèses quant aux mécanismes de régulation de ces voies ainsi que sur le rôle des lignanes dans la plante.