Élaboration d’outils de diagnostic morphologiques et moléculaires en vue d’identifier les charançons du colza et leurs hyménoptères parasitoïdes - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2016

Conception of morphologic and molecular diagnostic tools to identify oilseed rape weevils and their hymneopteran parasitoids

Élaboration d’outils de diagnostic morphologiques et moléculaires en vue d’identifier les charançons du colza et leurs hyménoptères parasitoïdes

Mélodie Ollivier

Résumé

Oilseed rape in France is the arable crop the most treated against pests. Seven species of weevils (Ceutorhynchus sp., Aulacobaris sp. and Melanobaris sp.) are known to attack oilseed rape all along its biological cycle, but the expression of their pest potential differs among species. Sixteen parasitoids contribute to the natural regulation of these pests. Conservation biological control is the sustainable approach supported by the COLEOTOOL project, as an alternative to the use of insecticides. Indeed, the rape winter stem weevil (C. picitarsis) already started to develop resistance to pyrethroids in France. The lack of recent data about host/parasitoids interactions and the difficulty to identify weevils and their parasitoids constitute the issue that the CBGP and the agronomical institute Terres Inovia, must solve by the development of molecular and morphological identification tools. Terres Inovia directed the sampling campaign over nine collection sites in France. The specimens have been identified by taxonomists at the CBGP, and the cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) of the mitochondrial gene has been sequenced for some of the specimens of the species identified. Phylogenetic inference, using maximum likelihood, has been employed to delineate species and study the congruence of morphological and molecular data. Further observations of vouchers permitted to correct identification errors, even describe new species characters for close species. The sequences of 108 weevils have been validated. They mostly belong to the four species the most represented in samplings (C. napi, C. obstrictus, C. pallidactylus et C. picitarsis). 145 sequences of parasitoids hymenoptera have been validated, belonging to 12 different species. Among them, ten did not present any sequence accessible on global database. A reference collection of specimen accompanies the sequence database. Tow digital polytomous keys has been created using LUCID software, dedicated to weevils and their parasitoids. They integrate a larger spectrum of species and characters newly reviewed. Thanks to these tools Terres Inovia will be able to analyse samples coming from a large network of plots in France, aiming at studying the favourable factors to conservation biological control of rape weevils.
Le colza oléagineux est la grande culture qui consomme le plus d’insecticides en France. Sept espèces de charançons, présentant une nuisibilité variable, et seize espèces de parasitoïdes constituent le cortège associé à cette culture. La lutte biologique par conservation est l’approche durable soutenue par le projet COLEOTOOL, comme alternative à la lutte chimique devenue inefficace sur certains ravageurs. La difficulté à identifier les charançons et leurs parasitoïdes et le manque de données récentes sur ces relations de parasitismes constitue la problématique à laquelle répondent le CBGP et Terres Inovia par l’élaboration d’outils de diagnostic morphologiques et moléculaires. Les spécimens collectés en France ont été identifiés morphologiquement et le gène de la cytochrome c oxydase 1 (CO1) du génome mitochondrial a été séquencé pour quelques individus des différentes espèces obtenues. L’inférence d’arbres phylogéniques par maximum de vraisemblance a permis d’étudier la congruence des résultats morphologiques et moléculaires. Une base de séquences de référence a ainsi été créée, contenant 108 séquences de charançons et 145 d’hyménoptères parasitoïdes de ces charançons. 10 de ces espèces ne présentaient jusqu’à présent aucune séquence dans les bases de données mondiales. Des systèmes d’identification interactifs ont aussi été conçus via le logiciel LUCID®. Grâce à ces outils Terres Inovia est en mesure d’analyser les échantillons issus d’un large réseau de parcelles pour étudier les variables favorables à la lutte biologique par conservation contre les charançons du colza en France.
Fichier principal
Vignette du fichier
2016_Ollivier_Mélodie_PPE.pdf (3.9 Mo) Télécharger le fichier

Dates et versions

dumas-01467993 , version 1 (15-02-2017)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-01467993 , version 1

Citer

Mélodie Ollivier. Élaboration d’outils de diagnostic morphologiques et moléculaires en vue d’identifier les charançons du colza et leurs hyménoptères parasitoïdes. Sciences agricoles. 2016. ⟨dumas-01467993⟩
280 Consultations
930 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More