Si le pistachier dit ‘vrai’ (Pistacia vera L.) est actuellement largement cultivé, le genre Pistacia comprend plusieurs autres espèces, sauvages, dont les usages traditionnels sont multiples. Les fréquentes attestations d’endocarpes (la partie interne et lignifiée du fruit du pistachier) sur les sites préhistoriques d’Asie du Sud-Ouest indiquent que les pistachiers constituaient une ressource couramment utilisée également dans le passé. En l’absence d’une étude systématique portant sur la morphologie des fruits, les restes archéobotaniques de pistache ne peuvent pas être identifiés jusqu’à l’espèce et cette difficulté nous prive d’informations fondamentales sur leur distribution géographique et leurs utilisations passées. Le premier objectif du présent travail était la création d’un référentiel d’endocarpes modernes représentant les espèces poussant dans la région méditerranéenne, en Anatolie et au Proche-Orient. À partir de ces individus nous avons utilisé trois approches afin d’explorer et décrire leur variabilité morphologique : une étude morphologique et des analyses en morphométrie traditionnelle et géométrique. Les résultats obtenus ont été appliqués aux échantillons archéologiques pour aboutir pour la première fois à des identifications spécifiques pour les restes archéologiques de pistachier provenant de sites néolithiques en Asie du Sud-Ouest. Ces données, jusqu’alors inconnues, nous ont permis d’entamer une discussion sur leurs implications en termes de paléo-environnements et utilisation des ressources.