Nouvel outil d’analyse en cytométrie en flux : application à l’immunophénotypage de la LLC - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2018

New analysis tool in flux cytometry: application to CLL immunophenotyping

Nouvel outil d’analyse en cytométrie en flux : application à l’immunophénotypage de la LLC

Résumé

CLL is the most frequent leukemia in the world. Immunophenotyping by flux cytometry is fundamental for the diagnosis and follow-up of this disease : diagnosis uses the Matutes score and follow up uses MRD determination. However operator and biologist subjectivity remains inevitable during acquisition and analysis of flux cytometry data. This work is about finding a way to limit this subjectivity. It describes an analysis protocol elaborated with the help of the Flowsom software that aim to limit the inconveniences of conventional flux cytometry by proposing a different but complementary strategy to it. It has been established in the context of the immunophenotyping of a patient who had CLL. Results are encouraging, from cell populations numeration to the finding of the pathological population or even to the determination of positivity thresholds. The observation of cell populations is more complete and less subjective than in classical cytometry. This protocol is ready to be tested on a significant amount of samples in the context of CLL but also of non Hodgkinian B lymphomas. That will allow generation of important informations about the benefit of using this tool in medical biology. Depending on the results, antibody panels used in cytometry could be subject to evolution.
La LLC est la leucémie la plus fréquente au monde. L’immunophénotypage par cytométrie en flux est un examen indispensable pour le diagnostic et pour le suivi de cette maladie : le diagnostic repose sur l’établissement du score de Matutes et le suivi de la rémission sur la détermination de la MRD. Cependant la subjectivité de l’opérateur et du biologiste reste incontournable lors de l’acquisition et de l’analyse des données en cytométrie. Ce travail s’intéresse à un moyen de limiter cette subjectivité. Il décrit un protocole d’analyse élaboré à l’aide du logiciel Flowsom, qui vise à limiter les inconvénients de la cytométrie conventionnelle en proposant une stratégie différente mais complémentaire de celle-ci. Il a été élaboré dans le cadre de l’immunophénotypage d’un patient atteint de LLC. Les résultats sont encourageants, que ce soit pour la numération des populations cellulaires, le repérage de la population pathologique ou encore la détermination des seuils de positivité. L’observation des populations cellulaires est plus complète et moins subjective qu’en cytométrie classique. Ce protocole est prêt à être testé sur un nombre significatif d’échantillons dans le cadre de la LLC mais aussi des lymphomes B non Hodgkiniens. Cela permettra de générer plus d’informations quant à l’intérêt d’utiliser ce logiciel en biologie médicale. En fonction des résultats, les panels d’anticorps utilisés actuellement en cytométrie pourront être amenés à évoluer.
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dumas-01931472 , version 1 (22-11-2018)

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  • HAL Id : dumas-01931472 , version 1

Citer

Kavish Mohabeer. Nouvel outil d’analyse en cytométrie en flux : application à l’immunophénotypage de la LLC. Sciences pharmaceutiques. 2018. ⟨dumas-01931472⟩
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