Prévalence des délétions des gènes pfhrp2 et pfhrp3 chez Plasmodium falciparum sur le plateau des Guyanes - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2018

Prevalence of pfhrp2 and pfhrp3 gene deletions in Plasmodium falciparum parasites on the Guiana Shield

Prévalence des délétions des gènes pfhrp2 et pfhrp3 chez Plasmodium falciparum sur le plateau des Guyanes

Résumé

Since 2009, World Health Organization (WHO) recommends the biological diagnostic confirmation by either microscopy or rapid diagnostic test (RDT) of any clinical malaria cases before delivering appropriate antimalarial treatment. This recommendation led to increasing use of RDTs especially in remote areas with limited infrastructures. Most RDTs target the histidine-rich protein-2 antigen (PfHRP2) to detect Plasmodium falciparum. However, parasites deleted for the pfhrp2 gene encoding this protein have been described in Amazonia. The risk is then to misdiagnosed a P. falciparum case as a P. vivax one and to treat it with chloroquine. In the Guiana Shield, 20 to 30% of parasites are chloroquino-resistant. Due to human migration and the importance of RDTs in this region, increased surveillance of pfhrp2 deletion is required. Thus, isolates collected between 2015 and 2017 in French Guiana, Guyana and Venezuela were studied according to WHO recommendations to estimate the prevalence of parasites lacking the pfhrp2 and pfhrp3 genes. Eight amplifications analyzed two regions of the genes pfhrp2 and pfhrp3, junction exon 1-2 and exon 2, of the genes and their flanking genes. To assess the sample DNA quality and quantity and to select suitable isolates for molecular analysis, the protocol included a real-time PCR as a semi-quantitative method. A total of 690 isolates were analyzed. In Venezuela, 39% (IC95 [28.1 - 49.9]) of the parasites were pfhrp3 negative and 2.6% (IC95 [0-6.8]) pfhrp2 negative. In Guyana (n = 265) and French Guiana (n = 230), no parasite lacked the pfhrp2 gene and respectively 3.0% IC95 [0.9% - 5.1%] and 0.5% IC95 [0 - 1.5] were pfhrp3 negative. These robust data identify for the first time the presence of deleted pfhrp2 parasites in Venezuela and confirm their absence in Guyana and French Guiana. Therefore surveillance remains important in Venezuela. However, Pf-HRP2-based RDTs remain suitable diagnostic tools in the countries of this region.
Depuis 2009, l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) recommande de confirmer toute suspicion de paludisme avant un traitement antipaludique adapté en procédant à un diagnostic de certitude basé sur la recherche des plasmodies par microscopie ou test de diagnostic rapide (TDR). Cette recommandation a conduit à un essor des TDR qui sont devenus des outils diagnostic de choix dans les zones reculées aux infrastructures limitées. Ces TDR permettent entre autre la détection de Plasmodium falciparum par la recherche de la protéine -2-riche en histidine (Pf-HRP2). Des parasites délétés pour le gène pfhrp2, qui code cette protéine, ont cependant été décrits en Amazonie. Le risque est alors d’étiqueter à tort un accès à P. falciparum comme un accès à P. vivax et de le traiter par chloroquine alors que sur le plateau des Guyanes, 20 à 30% des parasites sont chloroquino-résistants. En raison des flux migratoires et de la place des TDR dans cette région, une surveillance accrue de ces délétions est nécessaire. Ainsi, des isolats collectés entre 2015 et 2017 en Guyane, au Guyana et au Venezuela ont été étudiés selon les recommandations de l’OMS afin d’estimer la prévalence des délétions au niveau des gènes pfhrp2/3. Huit PCR analysant les deux parties, jonction exon 1-2 et exon 2, des gènes pfhrp2 et pfhrp3 et leurs gènes adjacents ont ainsi été utilisées. Le protocole d’étude comprenait également une PCR en temps réel comme méthode semi-quantitative permettant d’évaluer la qualité et la quantité de l’ADN des isolats étudiés afin de sélectionner les échantillons analysables. Un total de 690 isolats a été étudié. Au Venezuela, 39% (IC95 [28,1 – 49,9]) des parasites présentaient une délétion au niveau du gène pfhrp3 et 2,6% (IC95 [0 – 6,8]) au niveau de pfhrp2. Au Guyana (n=265) et en Guyane (n=230), aucun parasite délété pour le gène pfhrp2 n’a été mis en évidence et respectivement 3,0% IC95 [0,9% - 5,1%] et 0,5% IC95 [0 – 1,5] pour le gène pfhrp3. Ces données robustes mettent pour la première fois en évidence des isolats délétés pour le gène pfhrp2 au Venezuela et confirme leur absence en Guyane et au Guyana. Par conséquent, la surveillance reste de mise au Venezuela mais les TDR basés sur Pf-HRP2 restent des outils diagnostic adaptés dans ces pays.
Fichier principal
Vignette du fichier
ThEse__Berthelot_Léna.pdf (10.85 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

dumas-02018247 , version 1 (13-02-2019)

Identifiants

Citer

Léna Berthelot. Prévalence des délétions des gènes pfhrp2 et pfhrp3 chez Plasmodium falciparum sur le plateau des Guyanes. Parasitologie. 2018. ⟨dumas-02018247⟩
143 Consultations
331 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More