Let-7 dynamic with extremely high field NMR
Étude de la dynamique de Let-7 par RMN très hauts champs
Résumé
Let-7 is a non-coding micro-RNA involved in various cellular mechanisms. It interacts with other RNAs as HMGA2, TRIM71 or LIN28, and its deregulation implies cancers. In order to understand how this micro-RNA works, it is important to know the interactions between him and its different partners at an atomic scale. For that, nuclear magnetic resonnance or NMR represents a powerful tool for molecular dynamic studies. Indeed, it allows us to observe various movements from picoseconds to seconds. Extraction of dynamic parameters from spectra allows us to characterize and describe existing interactions between two molecules. From sample production to spectra resolution, we will present in this dissertation our approach to study Let-7 dynamic and present our first results about its production and its analysis with NMR.
Let-7 est un micro-ARN non codant impliqué dans différents mécanismes cellulaires. Il interagit avec divers partenaires comme HMGA2, TRIM71 ou encore LIN28B, et sa dérégulation est à l'origine de certains cancers. Pour mieux comprendre le fonctionnement de ce micro-ARN, il est important de connaître les modalités d'interaction avec ses partenaires à l'échelle atomique. Pour cela, la résonnance magnétique nucléaire ou RMN, représente un outil puissant pour l'étude de la dynamique moléculaire à cette échelle. En effet, cela permet d'observer différents mouvements à des temps allant de la picoseconde à la seconde. L'extraction de paramètres dynamiques issus des spectres permet la modélisation et la caractérisation des interactions existantes entre deux molécules. De la production d'échantillons à la résolution de spectres, nous présentons dans ce mémoire la démarche d'étude de la dynamique de Let-7 ainsi que les premiers résultats obtenus sur sa production pour l'analyse en RMN.
Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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