Étude comparative de différentes méthodes d’évaluation de la sensibilité aux antibiotiques chez les bactéries du groupe Bacteroides fragilis ayant acquis un ou plusieurs mécanismes de résistance - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2021

Comparative study of different antibiotic susceptibility testing methods in bacteria of the Bacteroides fragilis group which acquired one or more resistance mechanisms

Étude comparative de différentes méthodes d’évaluation de la sensibilité aux antibiotiques chez les bactéries du groupe Bacteroides fragilis ayant acquis un ou plusieurs mécanismes de résistance

Résumé

Bacteroides from the fragilis group are the most frequent anaerobic bacteria isolated in bacteriemia and deep infections in Humans. These infections are treated by antibiotic agents such as metronidazole, penicilins with penicillinase inhibitors, carbapenems or macrolides. Despite adequate treatment, these infections are the cause of high mortality rates. Moreover, since the early 2000s, resistance within Bacteroides has been increasing, leading to more frequent treatment failures. The aim of this work was to compare different antibiotic susceptibility testing methods, used routinely in laboratories, with the reference method, the agar dilution method. The evaluated methods were two industrial kits of microplate broth microdilution method (Sensititre™ and Micronaut-S™) and the agar disk diffusion method. The strains tested came from a European collection of 55 Bacteroides fragilis group presenting one or more resistance mechanisms. Eleven frequent resistance genes have been searched in the collection and related to the phenotypic resistance. At the end of this work, results suggest that the disk diffusion method was the most efficient to determine the Bacteroides resistance profile, in particular to macrolides and penicillins with inhibitor, if a cut-off diameters increase are made for the last one. Meropenem has also been found to be more efficient than imipenem to determine carbapenems resistance.
Les Bacteroides du groupe fragilis sont des bactéries anaérobies les plus fréquemment isolées au cours d’infections profondes et de bactériémie à germes anaérobies stricts chez l’homme. Ces infections donnent lieu à des traitements antibiotiques faisant appel au métronidazole, aux pénicillines avec inhibiteurs de pénicillinases, aux carbapénèmes ou encore aux macrolides. Malgré une prise en charge adéquate, ces infections sont à l’origine de forts taux de mortalité. De plus, depuis le début des années 2000, les résistances au sein des Bacteroides sont en augmentation amenant à des échecs thérapeutiques plus fréquents. Ce travail avait pour objectif de comparer différentes méthodes antibiogrammes utilisables en routine au laboratoire, à la méthode de référence, la dilution en milieu solide avec l’ensemenceur multiple de type Steers. Les méthodes évaluées étaient deux kits de microdilution en milieu liquide (Sensititre™ et Micronaut-S™) et la diffusion de disques en milieu solide. Les souches testées provenaient d’une collection européenne de 55 Bacteroides du groupe fragilis présentant des résistances à une ou plusieurs familles antibiotiques. Une recherche de 11 gènes de résistances, les plus fréquents chez les Bacteroides, a également été faite et rapportée au phénotype observé. Au terme de ce travail, les résultats suggèrent que la méthode de diffusion de disques en milieu solide permettrait une meilleure détermination des résistances des Bacteroides spp. notamment pour les macrolides et les pénicillines avec inhibiteurs de pénicillinases à condition d’augmenter les diamètres critiques pour ces dernières. Il a également été constaté que le méropénème était plus efficace que l’imipénème dans l’identification des résistances aux carbapénèmes.
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Dates et versions

dumas-03439326 , version 1 (22-11-2021)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-03439326 , version 1

Citer

Bénédicte Langlois. Étude comparative de différentes méthodes d’évaluation de la sensibilité aux antibiotiques chez les bactéries du groupe Bacteroides fragilis ayant acquis un ou plusieurs mécanismes de résistance. Sciences pharmaceutiques. 2021. ⟨dumas-03439326⟩
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