Retrospective analysis of multiplex PCR results and their impact in current practice - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
Mémoires Année : 2021

Retrospective analysis of multiplex PCR results and their impact in current practice

Analyse rétrospective des résultats de PCR multiplexe et de leur impact en pratique courante

Résumé

Background: hospital-acquired pneumonia (HAP) and ventilator-associated pneumonia (VAP) are among leading causes of in-hospital infectious complications. They are associated with a significant rise in morbidity and intensive care unit (ICU) length of stay. Early and adequate antibiotherapy is a cornerstone of their management. Empirical broad-spectrum antibiotherapy is mandatory until definitive bacterial identification and antibiotic susceptibility testing results. During the last years, laboratory bacterial diagnosis saw the emergence of rapid multiplexed-Polymerase Chain Reaction (rm-PCR) syndromic molecular diagnosis assays for pneumonia giving results with much shorter turnaround times compared to actual standard bacterial diagnosis methods. This innovative rm-PCR diagnosis technique could yield interesting bacteriologie results that could help clinicians to earlier introduce effective antibiotics and to reduce wide-spectrum antibiotics use by quick antibacterial spectrum adaptation. Information upon clinical performance and routine use of this novative method is stilllacking. The main objective of this study was to evaluate the clinical performance of this panel versus standard bacteriological methods in a clinical setting.
Methods: we retrospectively examined medical data of 103 VAP and HAP suspicions occurring between March 20, 2020 and April30, 2021 in ICU-patients from 3 different teaching hospitals. We compared results from conventional bacteriology and from rm-PCR while examining the clinical evolution and treatment strategy modifications in response to bacteriologie results to analyze impact on antibiotherapy.
Results : data from 103 pneumonia episodes (48 patients) were analyzed.Conclusions : Rm-PÇR provides ICU clinicians with mostly safe and useful results in significantly quicker turnaround times. More clinical evidence is needed ta gain trust in this technique.
Contexte : la pneumonie nosocomiale (PAH) et la pneumonie associée à la ventilation assistée (PAV) sont parmi les principales causes de complications infectieuses à l'hôpital. Ils sont associés à une augmentation significative de la morbidité et de la durée de séjour en réanimation. Une antibiothérapie précoce et adéquate est la pierre angulaire de leur prise en charge. L'antibiothérapie empirique à large spectre est obligatoire jusqu'à l'identification définitive des bactéries et les résultats des tests de sensibilité aux antibiotiques. Au cours des dernières années, le diagnostic bactérien en laboratoire a vu l'émergence de tests de diagnostic moléculaire syndromique par Polymerase Chain Reaction (PCR) multiplexée rapide (rm-PCR) pour la pneumonie, donnant des résultats avec des délais d'exécution beaucoup plus courts par rapport aux méthodes de diagnostic bactérien standard actuelles. Cette technique de diagnostic innovante par rm-PCR pourrait donner des résultats bactériologiques intéressants qui pourraient aider les cliniciens à introduire plus tôt des antibiotiques efficaces et à réduire l'utilisation d'antibiotiques à large spectre par une adaptation rapide du spectre antibactérien. Les informations sur les performances cliniques et l'utilisation en routine de cette méthode innovante font encore défaut.
L'objectif principal de cette étude était d'évaluer les performances cliniques de ce panel par rapport aux méthodes bactériologiques standard dans un cadre clinique.
Méthodes : nous avons examiné rétrospectivement les données médicales de 103 suspicions de PAV et HAP survenues entre le 20 mars 2020 et le 30 avril 2021 chez ICU-patients de 3 hôpitaux universitaires différents. Nous avons comparé les résultats de la bactériologie conventionnelle et de la rm-PCR tout en examinant l'évolution clinique et les modifications de la stratégie thérapeutique en réponse aux résultats bactériologiques pour analyser l'impact sur l'antibiothérapie.
Résultats : les données de 103 épisodes de pneumonie (48 patients) ont été analysées. Les résultats ont été obtenus 2,4 jours avant la bactériologie conventionnelle. Soixante-deux (60%) tests étaient exactement concordants avec la bactériologie conventionnelle.
Conclusion : Rm-PÇR fournit aux cliniciens de soins intensifs des résultats pour la plupart sûrs et utiles dans des délais d'exécution beaucoup plus rapides. Plus de preuves cliniques sont nécessaires pour gagner la confiance dans cette technique.
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Dates et versions

dumas-03512646 , version 1 (05-01-2022)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-03512646 , version 1

Citer

Léopold Letouzé. Retrospective analysis of multiplex PCR results and their impact in current practice. Human health and pathology. 2021. ⟨dumas-03512646⟩
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