Aspergilloses invasives et Mucormycoses : revue bibliographique et évaluation diagnostique du kit de PCR Aspergillus spp.-Mucorales Mycogénie® - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2021

Invasive aspergillosis and Mucormycosis : literature review and diagnostic evaluation of PCR kit Aspergillus spp.-Mucorales Mycogénie®

Aspergilloses invasives et Mucormycoses : revue bibliographique et évaluation diagnostique du kit de PCR Aspergillus spp.-Mucorales Mycogénie®

Résumé

Mucormycosis and invasive aspergillosis are serious infections which are most often associated with nonspecific symptoms and therefore requires an early and appropriate management. Improving diagnostic methods is a key challenge for therapy optimization and reducing mortality rates associated with these diseases. This thesis is divided into two parts. First, a literature review describes the causative agents of these infections, their physiopathology and the current microbiological diagnostic tools, including the molecular biology techniques recently included in the 2019 EORTC / MSGERC recommendations for Aspergillus. Furthermore, we assessed the analytical performance and diagnostic value of the recently marketed Aspergillus spp.-Mucorales Mycogénie® PCR kit. By comparing the results obtained from 101 samples selected retrospectively and prospectively using this kit with other diagnostic methods (mycological culture, reference PCR, galactomannan antigens for Aspergillus), we obtained satisfactory results that allowed the implementation of this new technique at the Mycology Laboratory of the Bordeaux Hospital University Center. This study highlights the benefits of combining several samples and diagnostic methods as well as comparing the results to the clinical context in order to provide the most accurate interpretation possible. Therefore, these molecular biology techniques must be used to balance the strengths and limitations of other techniques in the diagnosis of invasive aspergillosis and mucormycosis.
Les mucormycoses et les aspergilloses invasives sont des infections graves avec une symptomatologie souvent peu spécifique, qui nécessitent une prise en charge précoce et adaptée. L’amélioration des méthodes diagnostiques est un enjeu majeur pour optimiser la thérapeutique et ainsi diminuer la mortalité de ces pathologies. Ce travail de thèse se compose en deux parties : tout d’abord une revue de la littérature décrivant les agents responsables de ces infections, leur physiopathologie et les outils diagnostiques microbiologiques actuels, notamment la biologie moléculaire récemment incluse dans les recommandations de l’EORTC/MSGERC en 2019 pour Aspergillus, puis une évaluation des performances analytiques et de l’intérêt diagnostique du kit de PCR Aspergillus spp.-Mucorales MycoGENIE®, récemment commercialisé. En comparant les résultats obtenus avec ce kit sur 101 échantillons, sélectionnés en rétrospectif et en prospectif, aux autres méthodes diagnostiques (culture mycologique, PCR de référence, antigènes galactomannanes pour Aspergillus), nous obtenons des résultats satisfaisants qui ont permis la mise en place de cette technique au laboratoire de Mycologie du CHU de Bordeaux. Cette étude souligne l’intérêt de combiner plusieurs prélèvements et méthodes diagnostiques ainsi que de confronter les résultats au contexte clinique pour avoir une interprétation la plus juste possible. La biologie moléculaire a donc tout sa place pour compléter les atouts et limites des autres techniques dans le diagnostic des aspergilloses invasives et des mucormycoses.
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

dumas-03557660 , version 1 (04-02-2022)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-03557660 , version 1

Citer

Laure Portejoie. Aspergilloses invasives et Mucormycoses : revue bibliographique et évaluation diagnostique du kit de PCR Aspergillus spp.-Mucorales Mycogénie®. Sciences du Vivant [q-bio]. 2021. ⟨dumas-03557660⟩
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