Molecular description of advanced sarcomas: prognostic and predictive markers in a pooled analysis of MOSCATO and ProfiLER studies
Analyses moléculaires de sarcomes avancés : recherche de facteurs pronostics et prédictifs en marge de deux essais de médecine de précision (ProfiLER et MOSCATO)
Résumé
Objective: sarcomas are rare and heterogeneous. The aim of this study was the molecular description of sarcomas, and identification of molecular alterations as prognostic or predictive of response to treatment.
Methods: molecular profiles and clinical data of patients included in two French multicentric prospective precision medicine clinical trials, MOSCATO and ProfiLER, were analyzed. Molecular analysis was done on archived tissue or fresh tumor biopsy, and consisted of NGS panels with aCGH. Correlations between clinical and molecular data were done using Chi2 or Fisher tests and Student or ANOVA tests, as required. Clinical and molecular data were included in univariate model using log-rank test to seek for correlation with overall survival (OS), disease-free survival (DFS) and progression-free survival with anthracyclines.
Results: 235 patients were included in this pooled analysis. The majority were soft-tissue sarcomas (73,2%), followed by bone sarcomas (20,8%) and GISTs (5,9%). The six most frequently altered genes were TP53, RB1, CDKN2A, PTEN, CDK4 and MDM2. First recurrence was metastatic in 130 patients and local in 40 patients. TP53 alterations were significantly correlated with metastatic rather than local relapse (p=0,02). The presence of TP53 mutation was significantly associated with worse outcomes in terms of DFS in log rank model (p=0,01) as well as in terms of OS from initial diagnosis (p=0,05).
Conclusion: a prognostic impact of TP53 mutations in patients with advanced sarcomas was suggested. These results warrant further confirmatory analysis.
Methods: molecular profiles and clinical data of patients included in two French multicentric prospective precision medicine clinical trials, MOSCATO and ProfiLER, were analyzed. Molecular analysis was done on archived tissue or fresh tumor biopsy, and consisted of NGS panels with aCGH. Correlations between clinical and molecular data were done using Chi2 or Fisher tests and Student or ANOVA tests, as required. Clinical and molecular data were included in univariate model using log-rank test to seek for correlation with overall survival (OS), disease-free survival (DFS) and progression-free survival with anthracyclines.
Results: 235 patients were included in this pooled analysis. The majority were soft-tissue sarcomas (73,2%), followed by bone sarcomas (20,8%) and GISTs (5,9%). The six most frequently altered genes were TP53, RB1, CDKN2A, PTEN, CDK4 and MDM2. First recurrence was metastatic in 130 patients and local in 40 patients. TP53 alterations were significantly correlated with metastatic rather than local relapse (p=0,02). The presence of TP53 mutation was significantly associated with worse outcomes in terms of DFS in log rank model (p=0,01) as well as in terms of OS from initial diagnosis (p=0,05).
Conclusion: a prognostic impact of TP53 mutations in patients with advanced sarcomas was suggested. These results warrant further confirmatory analysis.
Objectifs : les sarcomes sont des tumeurs rares et hétérogènes. Notre objectif principal est la description moléculaire des sarcomes avancés. Nos objectifs secondaires sont la recherche d’altérations moléculaires pronostiques ou prédictives de réponse au traitement.
Matériel et Méthodes : les profils moléculaires et données cliniques des patients traités pour des sarcomes inclus dans deux essais de médecine de précision, MOSCATO et ProfiLER, ont été analysés. Les analyses moléculaires consistaient en un panel de séquençage nouvelle génération et des puces d’hybridation génomique. Des tests de Student et du Chi2 ont été faits pour étudier la corrélation entre les anomalies moléculaires et les données cliniques. L’étude de survie a utilisé un modèle univarié du log-rank, pour la survie sans maladie, la survie globale et la survie sans progression sous anthracyclines.
Résultats : 235 patients ont été inclus. La maladie était initialement localisée chez 173 patients. La cohorte était constituée de 73,19% de sarcomes des tissus mous, 20,85% de sarcomes osseux et 5,96% de GIST. Les six gènes impactés le plus fréquemment étaient TP53, RB1, CDKN2A, PTEN, CDK4 et MDM2. Les altérations de TP53 étaient corrélées avec une rechute métastatique plutôt que loco-régionale (p=0,02). La présence d’une altération de TP53 était associée à une moins bonne survie sans maladie (p=0,01). Une altération de TP53 conférait un moins bon pronostic en termes de survie globale p=0,05).
Conclusion : un impact pronostic des altérations de TP53 est suggéré dans notre étude. Celui-ci nécessite des analyses complémentaires pour confirmation.
Matériel et Méthodes : les profils moléculaires et données cliniques des patients traités pour des sarcomes inclus dans deux essais de médecine de précision, MOSCATO et ProfiLER, ont été analysés. Les analyses moléculaires consistaient en un panel de séquençage nouvelle génération et des puces d’hybridation génomique. Des tests de Student et du Chi2 ont été faits pour étudier la corrélation entre les anomalies moléculaires et les données cliniques. L’étude de survie a utilisé un modèle univarié du log-rank, pour la survie sans maladie, la survie globale et la survie sans progression sous anthracyclines.
Résultats : 235 patients ont été inclus. La maladie était initialement localisée chez 173 patients. La cohorte était constituée de 73,19% de sarcomes des tissus mous, 20,85% de sarcomes osseux et 5,96% de GIST. Les six gènes impactés le plus fréquemment étaient TP53, RB1, CDKN2A, PTEN, CDK4 et MDM2. Les altérations de TP53 étaient corrélées avec une rechute métastatique plutôt que loco-régionale (p=0,02). La présence d’une altération de TP53 était associée à une moins bonne survie sans maladie (p=0,01). Une altération de TP53 conférait un moins bon pronostic en termes de survie globale p=0,05).
Conclusion : un impact pronostic des altérations de TP53 est suggéré dans notre étude. Celui-ci nécessite des analyses complémentaires pour confirmation.
Domaines
Médecine humaine et pathologieOrigine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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