Clinico-biological refinement of BCL11B related disorder and identification of a genome-wide dna methylation signature - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
Mémoires Année : 2023

Clinico-biological refinement of BCL11B related disorder and identification of a genome-wide dna methylation signature

Description clinico-biologique de la maladie liée au gène BCL11B et identification d'une signature épigénétique

Résumé

Purpose: BCL11B-related disorder (BCL11B-RD) arises from rare genetic variants within the BCL11B gene, resulting in a distinctive clinical spectrum encompassing syndromic neurodevelopmental disorder, with or without intellectual disability, associated with facial features and impaired immune function. This study presents an in-depth clinico-biological analysis of 20 newly reported individuals with BCL11B-RD, coupled with a characterization of genome-wide DNA methylation patterns of this genetic condition. Methods: through an international collaboration, clinical and molecular data from 20 individuals were systematically gathered, and a comparative analysis was conducted between this series and existing literature. We further scrutinized peripheral blood DNA methylation profile of individuals with BCL11B-RD, contrasting them with healthy controls and other neurodevelopmental disorders marked by established episignature. Results: our findings unveil rarely documented clinical manifestations, notably including Rubinstein-Taybi-like facial features, craniosynostosis, and autoimmune disorders, all manifesting within the realm of BCL11B-RD. We refine the intricacies of T cell compartment alterations of BCL11B-RD, revealing decreased levels naïve CD4+ T cells and recent thymic emigrants (RTE) while concurrently observing an elevated proportion of effector-memory expressing CD45RA CD8+ T cells (TEMRA). Finally, a distinct DNA methylation episignature exclusive to BCL11B-RD is unveiled. Conclusion: this study serves to enrich our comprehension of the clinicobiological landscape of BCL11B-RD, potentially furnishing a more precise framework for diagnosis and follow-up of individuals carrying pathogenic BCL11B variant. Moreover, the identification of a unique DNA methylation episignature offers a valuable diagnosis tool for BCL11B-RD, thereby facilitating routine clinical practice by empowering physicians to reevaluate variants of uncertain significance within the BCL11B gene.
La maladie liée au gène BCL11B (MIM 618092) est caractérisée par un trouble du neurodéveloppement syndromique associant un décalage des acquisitions, des variations morphologiques mineures et un déficit immunitaire. À ce jour, 29 patients ont été rapportés dans la littérature. Cette étude repose sur une description clinico-biologique de 20 nouveaux individus porteurs d’une variation pathogène du gène BCL11B, ainsi que sur l’analyse pangénomique de leur profil de méthylation. Méthodes : les données cliniques, immunitaires et moléculaires des 20 patients porteurs d’une variation pathogène du gène BCL11B ont été récoltées à partir d’une collaboration internationale, via un questionnaire standardisé, et comparées aux données de la littérature. L’analyse du méthylome, menée en collaboration avec le London Health Sciences Centre (Ontario, Canada), a été réalisée à partir d’ADN extrait sur prélèvement sanguin en utilisant la technologie du séquençage au bisulfite (Bi-Seq). Résultats : nous décrivons des manifestations cliniques peu documentées dans la littérature telles qu’une morphologie crânio-faciale évocatrice du syndrome de Rubinstein-Taybi, ainsi qu’un surrisque de craniosténose, de maladies autoimmunes et de comorbidités psychiatriques (i.e. trouble anxieux et comportement auto/hétéro-agressif). De surcroît, nous identifions une signature épigénétique spécifique de la maladie liée au gène BCL11B. Conclusion : cette étude enrichit nos connaissances du spectre clinico-biologique de la maladie liée au gène BCL11B, optimisant ainsi le diagnostic et la prise en charge des patients atteints de cette maladie rare. De surcroît, l’identification d’une signature épigénétique sensible et spécifique représente une véritable avancée pour le diagnostic de la maladie liée au gène BCL11B. Cette nouvelle analyse pourra désormais être déployée en pratique quotidienne afin, notamment, d’aider à la reclassification des variations de signification incertaine du gène BCL11B.
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Citer

Quentin Sabbagh. Clinico-biological refinement of BCL11B related disorder and identification of a genome-wide dna methylation signature. Human health and pathology. 2023. ⟨dumas-04550729⟩
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