Intégration des explorations génétiques à la démarche diagnostique de la maladie rénale chronique chez l'adulte de moins de 45 ans
Résumé
Background: recent data suggests that monogenic kidney disease may be an underestimated etiology of chronic kidney disease (CKD), given that the underlying cause often remains unknown. Since 2019 adult patients with early onset CKD of unknown etiology (<45 years old), in which both diagnostic yield and clinical impact are expected to be greater, are eligible for a national French genomics program. However few studies have assessed the practical implementation of genetic testing for adults under age 45 with CKD.
Methods: we performed an observational study on 502 patients aged 18 to 45 years old referred to a nephrology consultation for CKD at an academic medical center between January 2006 and December 2020. After describing the CKD phenotype and underlying etiology of each patient we established groups in which genetic testing should be performed or discussed based on current recommendations. We then compared characteristics of patients that had undergone genetic testing from onset of CKD to December 2022 to those who had not.
Results: glomerular phenotype was predominant (51%), followed by cystic (19%), congenital anomalies of the kidney and the urinary tract (11%), tubulo-interstitial (9%) and vascular (4%) and other (6%) phenotypes. Median age was 36 years, 59% of patients were at early CKD (stage I or II), 39% had a kidney biopsy. Family history of kidney disease was reported in 120 patients (24%) and syndromic features in 21 patients (4%). We identified a strong indication for genetic testing for 92 patients (18%) and a possible one for 60 patients (12%). Amongst them respectively 21 (23%) and 5 (8%) patients had genetic testing. Young age (p=0.01), recent first evaluation (<0.01), family history (p<0.01), syndromic features (p<0.01) and cystic disease (p=0.02) were associated with genetic testing. Most of genetic testing was done by targeted gene panel sequencing. Diagnostic yield was 63% (20 out of 32 patients).
Conclusion: 1 out of 5 adults under age 45 with CKD need diagnosis genetic testing according to current recommendations. Only 23% of these had a genetic test, underlining the need for adult nephrologists to be better informed about these new strategies. This study identifies subgroups of patients less likely to be screened. Further guidelines are required to clarify indications and conditions of genetic evaluation of patients with CKD in clinical settings.
Des données récentes suggèrent que la participation des maladies rénales monogéniques à la maladie rénale chronique (MRC) de l’adulte est probablement sous-estimée, la cause de la MRC restant fréquemment indéterminée. Depuis 2019 les adultes avec une MRC d’origine indéterminée au début précoce (moins de 45 ans), chez qui le rendement diagnostique et l’enjeu clinique sont particulièrement importants, font l’objet d’un plan génomique national. Cependant peu d’études se sont intéressées à l’intégration en pratique clinique des explorations génétiques chez les adultes jeunes suivis en néphrologie pour MRC.
Méthodes : nous avons mené une étude observationnelle incluant 502 patients adultes âgés de moins de 45
ans consultant en néphrologie au CHU de Nîmes de janvier 2006 à décembre 2020 pour MRC. Après description du phénotype et de l’étiologie retenus de la MRC sur des arguments cliniques et histologiques, nous avons identifié selon les dernières recommandations les patients avec une indication forte d’analyse génétique et ceux avec une indication à discuter. Nous avons ensuite analysé les caractéristiques des patients ayant bénéficié d’une analyse génétique à partir du suivi initial jusqu’en décembre 2022, comparativement à ceux n'en ayant pas bénéficié.
Résultats : le phénotype rénal des patients était majoritairement glomérulaire (51 %), puis kystique (19 %), lié à des anomalies congénitales des reins et voies urinaires (11 %), tubulo-interstitiel (9 %), vasculaire (4 %) et autre (6 %). L’âge médian était de 36 ans, 49 % des patients étaient des femmes, 59 % présentaient un stade précoce de MRC (stade I ou II) et 39 % avaient eu une biopsie rénale. Un antécédent familial néphrologique était rapporté pour 120 patients (24 %) et un signe extra rénal pour 21 patients (4 %). Nous avons identifié une indication forte d’analyse génétique pour 92 patients (18 %) et une indication à discuter pour 60 patients (12 %). Parmi eux respectivement 21 (23 %) et 5 (8 %) patients avaient bénéficié d’une exploration génétique. Les facteurs associés à la demande d’une exploration était un âge précoce (p = 0,01), une prise en charge récente (p < 0,01), un antécédent familial néphrologique (p < 0,01), un signe extra rénal (p < 0,01) et une néphropathie kystique (p = 0,02). La principale modalité d’analyse génétique était des panels de gènes ciblés. Une anomalie génétique était objectivée chez 22 patients parmi 32 explorés (63 %).
Conclusion : dans notre cohorte 1 adulte sur 5 de moins de 45 ans avec MRC nécessiterait une exploration
génétique d’après les recommandations actuelles. Seulement 23 % d’entre eux ont bénéficié d’une exploration ce qui souligne l’intérêt de mieux informer les néphrologues adultes de ces nouvelles stratégies. Nous avons identifié le profil des patients les moins dépistés. Des recommandations supplémentaires sont nécessaires pour clarifier les indications et modalités des tests génétiques chez les patients avec MRC et faciliter leur intégration en pratique clinique.