Facteurs de variation du portage et de l'excrétion des <i>Escherichia coli</i> entérohémorragiques O26:H11 : étude chez les jeunes veaux laitiers en zone AOP lait cru de montagne - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
Mémoires Année : 2023

Factors influencing the carriage and shedding of enterohaemorragic Escherichia coli 026:H11 : young dairy calves in PDO mountain raw milk zone study

Facteurs de variation du portage et de l'excrétion des Escherichia coli entérohémorragiques O26:H11 : étude chez les jeunes veaux laitiers en zone AOP lait cru de montagne

Résumé

Enterohaemorrhagic Escherichia coli are responsible for human infections, which can be complicated by Haemolytic Uremic Syndrom, sometimes fatal. Contaminations often occurs through contaminated food consumption, such as undercooked minced meat or products containing raw milk. Cattle are the main reservoir of EHEC and shed it asymptomatically, making it difficult to detect. The aim of this study was both to evaluate the agreement between two sampling methods and to determine factors influencing EHEC O26:H11 shedding by dairy calves. To do this, 57 calves from four farms were sampled three to four times from birth to weaning and key events in their lives were recorded. In addition, meteorological data was collected via sensors. This study is an initial processing of the results of a larger project, called “ConEHECtion”. Our study assessed that agreement between faeces sampling and recto-anal junction swab was moderate for primary analysis (kappa = 0,53 [0,38; 0,67]95%), substantial for confirmation analysis (kappa = 0,61 [0,33; 0,89]95%) and moderate for the overall result (kappa = 0,58 [0,41; 0,75]95%). A logistic model was also used to assess the impact of some factors on EHEC O26:H11 shedding. Our study showed that recent group housing significantly increased EHEC O26:H11 shedding (OR = 5,25 et p = 0,036). Similarly, calves aged 21 to 30 days and 56 to 64 days shed the bacteria more often than calves aged 0 to 7 days (OR = 51,4, p = 0,002 and OR = 167, p < 0,001 respectively). On the other hand, a decrease in minimum relative humidity over the four days prior to sampling increased the probability of shedding bacteria (OR = 0,69 et p = 0,028). However, the other parameters tested, such as farm effect, temperature or THI, were not significantly associated with EHEC O26:H11 shedding. A better understanding of factors determining this pathogen shedding on farms is essential given its impact on public health and contaminations it still causes on a regular basis. It is essential to develop appropriate control methods at farm level, and this is one of the goals of the “ConEHECtion” project’s continuation.
Les Escherichia coli entérohémorragiques sont responsables d’infections chez les humains, pouvant se compliquer en un Syndrome Hémolytique et Urémique parfois mortel. La contamination se fait souvent par l’ingestion d’aliments contaminés, comme notamment la viande hachée insuffisamment cuite ou les produits contenant du lait cru. Les bovins constituent le réservoir principal des EHEC et les excrètent de façon asymptomatique, rendant difficile leur détection. Les objectifs de cette étude étaient à la fois d’évaluer la concordance entre deux méthodes de prélèvement et de déterminer les facteurs de variation de l’excrétion des EHEC O26:H11 par les veaux laitiers. Pour cela, 57 veaux laitiers de quatre fermes ont été prélevés trois à quatre fois entre la naissance et le sevrage et les événements marquants de leur vie ont été relevés. De plus, des données météorologiques ont été recueillies via des capteurs. Cette étude réalise un premier traitement des résultats d’un projet plus large, nommé « ConEHECtion ». Notre étude a évalué la concordance entre le prélèvement de fèces et l’écouvillon de la jonction recto-anale comme étant modérée pour l’analyse de 1ère intention (kappa = 0,53 [0,38 ; 0,67]95%), importante pour l’analyse de confirmation (kappa = 0,61 [0,33 ; 0,89]95%) et modérée pour le résultat global (kappa = 0,58 [0,41 ; 0,75]95%). D’autre part, un modèle logistique a été réalisé afin d’évaluer l’impact de certains paramètres sur l’excrétion d’EHEC O26:H11. Notre étude a mis en évidence qu’un allotement récent augmentait significativement l’excrétion des EHEC O26:H11 (OR = 5,25 et p = 0,036). De même, les veaux âgés de 21 à 30 jours et de 56 à 60 jours excrétaient plus souvent la bactérie que les veaux âgés de 0 à 7 jours (OR = 51,4, p = 0,002 et OR = 167, p < 0,001 respectivement). En revanche, une baisse de l’humidité relative minimale sur les quatre jours précédant le prélèvement augmentait la probabilité d’excrétion de la bactérie (OR = 0,69 et p = 0,028). Cependant, les autres paramètres testés tels que l’effet de la ferme, la température ou le THI n’étaient pas significativement associés à l’excrétion d’EHEC O26:H11. Mieux comprendre les facteurs régissant l’excrétion de ce pathogène au sein des élevages est essentiel au vu de son impact dans le domaine de la santé publique et des contaminations encore régulières qu’il provoque. Développer des moyens de maîtrise adaptés à l’échelle de la ferme apparaît comme une nécessité et constitue l’un des objectifs de la suite du projet « ConEHECtion ».
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Citer

Marie Ramette. Facteurs de variation du portage et de l'excrétion des Escherichia coli entérohémorragiques O26:H11 : étude chez les jeunes veaux laitiers en zone AOP lait cru de montagne. Médecine vétérinaire et santé animale. 2023. ⟨dumas-04616092⟩
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