Mémoires Année : 2017

Bibliographic analysis of the molecular interactions involved in the viral escape from the interferon pathway

Analyse bibliographique du rôle des interactions moléculaires dans l'échappement des virus à la voie interféron

Résumé

Type I interferons are crucial cytokines for the innate immunity especially against the viral infections. Most of viruses have evolved strategies to counteract the induction, signalization and antiviral effectors of the interferon pathway within infected hosts. This study aimed to list all the viral antagonists that target the type I interferon pathway that have been published in scientific reviews before July 2016. More than 190 viral interferon antagonists encoded by less than 140 distinct viruses have been described. Five main counteracting strategies are used by viruses to dampen the IFN pathway: direct protein- protein interaction, post-translational modifications, expression inhibition, action on protein stability and action on viral nucleic acids. Several viral interferon antagonists are conserved throughout distinct RNA virus families, whereas DNA viruses have a larger genome so they encode several different antagonists. However, DNA viruses use same mechanisms as RNA viruses to counteract the interferon pathway. According to our study, viruses use different antagonistic mechanisms or target different levels of the interferon pathway, according to their nature (zoonotic or arbovirus) or the infected host. The interactions between viruses and their hosts define a positive selection for some of the key components of the interferon system and viral determinants. The understanding of viral antagonist mechanisms enables future research for the development of vaccines and antiviral therapies.

Les interférons de type I sont des cytokines essentielles dans l’immunité innée et particulièrement pour la lutte contre les infections virales. La plupart des virus ont développé des stratégies pour déjouer l’induction, la signalisation et les effecteurs antiviraux de la voie interféron des hôtes qu’ils infectent. Cette étude répertorie tous les exemples d’antagonisme viral vis-à-vis de la voie interféron de type I ayant fait l’objet d’un article scientifique publié avant juillet 2016. Plus de 340 antagonistes viraux des interférons, provenant d’un peu moins de 140 virus différents, ont été identifiés. Les virus utilisent cinq modes d’action principaux pour déjouer la voie interféron : une interaction directe protéine-protéine, la modification post-traductionnelle, l’inhibition de l’expression, l’action sur la stabilité protéique et l’action sur les acides nucléiques viraux. Plusieurs antagonistes viraux sont conservés dans des familles de virus à ARN distinctes, alors que les virus à ADN ont un plus vaste génome et donc codent pour un plus grand nombre d’antagonistes différents. Cependant, les virus à ADN utilisent des mécanismes communs aux virus à ARN pour contrer la voie interféron. Nous avons constaté que selon leur nature (zoonotique ou arbovirus) ou les hôtes qu’ils infectent, les virus utilisent préférentiellement certains mécanismes d’antagonisme ou inhibent certains niveaux de la voie interféron. Les interactions hôte-virus déterminent une sélection positive de quelques éléments clé de la voie interféron et des déterminants viraux. La compréhension des mécanismes des antagonistes viraux permet d’envisager le développement de stratégies vaccinales et de thérapies antivirales.

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Emilie Poiret. Analyse bibliographique du rôle des interactions moléculaires dans l'échappement des virus à la voie interféron. Médecine vétérinaire et santé animale. 2017. ⟨dumas-05030245⟩
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