Lors de cette étude, la méthode de modélisation inverse a été utilisée pour construire un modèle d'équilibre de masse de l'estuaire et du nord du golfe du Saint-Laurent, pour la période de 2006 à 2010. Le système a été divisé en 44 groupes fonctionnels allant du phytoplancton et des détritus, aux mammifères et oiseaux marins, incluant les principales espèces pélagiques, démersales et benthiques. L'objectif général de l'étude est de déterminer la structure et le fonctionnement des communautés de l'écosystème étudié. Des informations existent déjà pour les communautés benthiques et pélagiques de l'écosystème du Saint-Laurent, cependant, aucune description globale de son fonctionnement n'a été faite. La modélisation des liens trophiques entre les compartiments de l'écosystème est une bonne méthode de description, car elle permet de construire une vue d'ensemble du réseau trophique. La première étape a été d'effectuer la collecte et l'analyse des données de base pour les différents groupes étudiés. Un modèle écosystémique a ensuite été élaboré à partir de ces données. Les résultats du modèle permettront d'obtenir une description globale de la structure de l'écosystème, des interactions trophiques et des impacts relatifs de la prédation et de la pêche sur les communautés de vertébrés et invertébrés de l'écosystème pour la période de 2006 à 2010.