Sélection génomique des races ovines laitières françaises : analyse des schémas actuels, première modélisation de scénarios génomiques et bilan technico-économique
Abstract
Over the last few years, genomic selection has become an important tool used in dairy cattle breeding programs. There are many arguments in support of the adoption of genomic selection in this species such as the reducing of the generation interval and the significant increase of the genetic gain. Therefore, the dairy sheep sector has invested in projects such as Genomia and Roquefort'in to study the technical and economical relevance of genomics in dairy sheep AI centres. First, the current breeding schemes were described to precisely assess the AI demand, the ram's capacity of diffusion, the actual breeding schemes organisation and their annual genetic gain. Thanks to the data gathered, we determine, for the Lacaune and Pyrenean breeds, the essential parameters required to establish a genomic selection program. The modelling of different genomic breeding design was studied in the case of the Lacaune breed. The first results are encouraging: the transition to genomics seems technically et economically feasible. The annual genetic gain could be increased up to 10 to 20% compared to the current one without increasing the scheme's costs. However, this is a preliminary modelling and has to be improved. Different parameters dealing with the genetic variability and mother-son pathway need to be taken into account. Furthermore, the modelling will be applied to the other breeds and specified in close co-operation with the different breeding companies and breed associations.
Depuis quelques années, la sélection génomique est devenue le maître mot en élevage. Doublement du progrès génétique annuel, réduction de l'intervalle de génération, meilleure connaissance de la valeur génétique des jeunes animaux : autant d'arguments avancés en bovins laitiers qui ne sont pas sans interpeller les professionnels de la filière ovine laitière. Des projets d'envergures ont donc été mis en place en vue d'étudier les possibilités d'applications de cette innovation en ovins laitiers. Parmi eux, les projets Genomia et Roquefort'In, dans lesquels s'inscrit ce stage, s'intéressent plus particulièrement à la pertinence technico-économique de la sélection génomique, en s'appuyant sur la gestion des béliers en centre d'insémination animale (IA) et en modélisant divers scénarios de schémas génomiques. Pour cela, les programmes actuels des races Lacaune et Pyrénéennes ont été décrits pour connaître la demande en IA, l'utilisation et les capacités physiologiques des béliers, l'organisation actuelle des schémas et leur progrès génétique réalisé. Les données ainsi récoltées ont permis de disposer de paramètres indispensables à la modélisation de schémas génomiques. La modélisation de divers scénarios a été réalisée en race Lacaune. Les premiers résultats sont encourageants et laissent à penser que la transition est techniquement et économiquement envisageable pour cette race et qu'il est possible d'améliorer le gain génétique annuel de l'ordre de 10 à 20% sans augmenter les coûts du schéma. Cependant, la modélisation reste perfectible. Plusieurs paramètres, tels que la variabilité génétique ou la voie mère-fils n'ont pas encore été pris en compte. En outre, la modélisation doit être appliquée à chacune des races et affinée en étroite collaboration avec les entreprises de sélection des différentes races.
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