Impact de l'approche moléculaire sur la classification systématique des Agaricomycetidae - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Access content directly
Master Thesis Year : 2013

Impact de l'approche moléculaire sur la classification systématique des Agaricomycetidae

Abstract

aAppeared in the 90s, the molecular methods, especially PCR and sequencing, have allowed for a major breakthrough in the area of mushroom phylogeny. This allowed for a deep reform of the systematic classification that was based only on morphological characteristics, opening the way for several new levels of classification. This highlighted several discrepancies between the molecular and systematic approaches. Thus, after a careful review of the principal systematic classification criteria and the various molecular markers, the sub-class of the Agaricomycetidae, which encompasses most of the edible and toxic mushrooms, will be compared to each type of approach. Although the molecular approach regroups several species with different morpho-anatomical features in a single phylogenetic group, it allows for easy distinction between species that are close morphologically, and for which confusing one for another could lead to food poisoning. Hence, shedding light on nucleotidic sequences mutations, molecular biology allowed us to distinguish species and genders Tricholoma, Lepista and Clitocybe for which systematic identification could be ambiguous. Nevertheless, the systematic approach remains inevitable in the field for identication (morpho-anatomical, environmental and key identification criteria).
Apparues dans les années 90, les méthodes moléculaires notamment la PCR et le séquençage, ont permis une avancée majeure dans le domaine de la phylogénie des champignons. La classification systématique, qui se base uniquement sur les principaux caractères morphologiques, en a été considérablement remaniée, laissant apparaître plusieurs niveaux de classification avec des divergences profondes entre les approches moléculaires et systématiques. Ainsi, après un rappel sur les principaux critères de classification systématique et les différents marqueurs moléculaires, la sous-classe des Agaricomycetidae, qui rassemble la plupart des champignons comestibles et toxiques, est comparée selon chaque type d'approche. Bien que l'approche moléculaire rassemble dans un seul groupe phylogénétique des espèces possédant des caractères morpho-anatomiques distincts, elle permet aisément la distinction entre des espèces proches morphologiquement et dont la confusion peut entraîner des intoxications alimentaires. Ainsi, par la mise en évidence de mutations dans les séquences nucléotidiques, la biologie moléculaire nous a permis de distinguer des espèces des genres Tricholoma, Lepista et Clitocybe dont l'identification systématique peut être ambiguë. En revanche, l'approche systématique reste encore incontournable sur le terrain pour les identifications (critères morpho-anatomiques, environnementaux, clefs d'identification).
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Dates and versions

dumas-00808615 , version 1 (05-04-2013)

Identifiers

Cite

Adrien Chaboud. Impact de l'approche moléculaire sur la classification systématique des Agaricomycetidae. Sciences pharmaceutiques. 2013. ⟨dumas-00808615⟩
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