La distribution des évènements de crossing-over, un paramètre modulable chez les Brassicas - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Access content directly
Master Thesis Year : 2013

La distribution des évènements de crossing-over, un paramètre modulable chez les Brassicas

Alexandre Pelé

Abstract

Meiotic recombination by Crossover (CO) is the primary mechanism for the genetic mixing of diversity in the production of offspring in breeding programs. However, the number and distribution of COs are strictly regulated. Indeed, there is still a CO per chromosome, but rarely more and their distribution is not uniform along the chromosome. Yet in Brassicas, it is possible to increase by a factor of 6 the rate of recombination between the genomes A in AAC triploid hybrid (2n = 29) compared with the AA diploid (2n = 20), due to the nature of C chromosomes in addition, particularly to the C9. It is now possible to make a physical connection with these changes in the frequency of recombination with the recent sequencing of the genomes of B. rapa and B. napus. The purpose of this study is to understand how the genomic structure of chromosome A07 determines the formation of COs and to determine the effect of the addition of C9 chromosome and the 9 chromosomes C in a diploid AA on COs distribution. To make this, we have (1) selected three areas contrasted for the frequency of recombination on chromosome A07 on AA, AA+1C9 and AAC populations, and (2) densified and mapped microsatellite markers physically anchored every 300 Kb to characterize these areas. We have shown that the distribution of COs along chromosome A07 is explained by the genomic structure in AA diploid. New points of recombination occur in the presence of C9 chromosome and 9 chromosome C in cold regions in the AA control and especially in pericentromeric regions. These findings offer the prospect of breaking some linkage disequilibrium and stir retained loci in plant breeding.
La recombinaison méiotique, par l'intermédiaire de crossing-over (CO) est le principal mécanisme permettant le brassage génétique de la diversité lors de la production de descendance dans les programmes de sélection variétale. Cependant, le nombre et la répartition des COs sont strictement régulés. En effet, il existe toujours un CO par chromosome mais très rarement plus et leur distribution n'est pas homogène le long des chromosomes. Pourtant, chez les Brassicas, il est possible d'augmenter d'un facteur 6 le taux de recombinaison entre les génomes A chez les hybrides triploïdes AAC (2n=29) par rapport aux diploïdes AA (2n=20), grâce à la nature des chromosomes C en addition et notamment du chromosome C9. Les séquençages récents des génomes de B. rapa et de B. napus permettent désormais de faire le lien physique avec ces variations de la fréquence de recombinaison. L'objectif de cette étude est donc de comprendre comment la structure génomique du chromosome A07 conditionne la formation des COs et de déterminer l'effet de l'addition du chromosome C9 et des 9 chromosomes C chez un diploïde AA sur leur distribution. Nous avons pour ce faire (1) choisi 3 zones contrastées pour la fréquence de recombinaison sur le chromosome A07 chez les populations AA, AA+1C9 et AAC et (2) densifié puis cartographié des marqueurs microsatellites physiquement ancrés tous les 300 Kb pour caractériser ces zones. Nous avons ainsi montré que la distribution des COs le long du chromosome A07 est expliquée par sa structure génomique chez des diploïdes AA. De nouveaux points de recombinaison apparaissent en présence du chromosome C9 et des 9 chromosomes C dans des régions froides chez le témoin AA et notamment dans les régions péricentromériques. Ces résultats offrent ainsi la perspective de pouvoir briser certains déséquilibres de liaison et de brasser ces locus conservés en sélection variétale.
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Dates and versions

dumas-00966024 , version 1 (26-03-2014)

Identifiers

  • HAL Id : dumas-00966024 , version 1

Cite

Alexandre Pelé. La distribution des évènements de crossing-over, un paramètre modulable chez les Brassicas. Sciences agricoles. 2013. ⟨dumas-00966024⟩
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