Le site Natura 2000 cours d'eau "Gave d'Oloron et Marais de Labastide-Villefranche" (Pyrénées-Atlantiques) est actuellement dans sa phase de diagnostic écologique. Pour cela, une cartographie des habitats naturels est nécessaire. Le réseau hydrographique trop dense et ramifié pour être parcouru dans son intégralité a fait l'objet d'une modélisation de son linéaire sur la base de paramètres environnementaux. Une classification hydro-écologique est obtenue par leur croisement. De précédentes versions de cette modélisation ont engendré des modifications : le paramètre de la pente est venu remplacer celui de la géologie. Les autres paramètres sont le rang de Strahler, l'altitude, et l'éclairement du lit. Les habitats observés au sein des échantillons parcourus sont extrapolés aux tronçons non parcourus possédant les mêmes paramètres. L'analyse fait ressortir les rôles de la pente, de l'altitude et de l'éclairement dans le déterminisme des habitats aquatiques et riverains, et permet de légitimer l'extrapolation des habitats naturels les plus observés. Une validation intégrale de la modélisation sera rendu possible par de nouvelles prospections hors échantillon afin de confronter les données ainsi recueillies aux données ayant été extrapolées. Enfin, une version amendée par cette étude pourra être utilisée pour de prochain site Natura 2000 cours d'eau.