Création et caractérisation de marqueurs SSR pour la fétuque rouge traçante - Festuca rubra subsp. Rubra - et étude de diversité génétique

Résumé : La prise de conscience des impacts environnementaux négatifs des produits chimiques utilisés pour l’entretien des gazons ainsi que les nouvelles attentes des consommateurs et des producteurs mènent à l’apparition d’un nouveau marché : les gazons à faible entretien. Du fait de son adaptation aux milieux pauvres, salins et secs, la fétuque rouge traçante, Festuca rubra subsp. Rubra, correspond parfaitement aux critères des gazons à faible entretien. Cette étude a pour objectifs d’appliquer les techniques moléculaires à cette sous-espèce. 22 marqueurs SSR polymorphes ont été testés sur 95 génotypes de fétuque rouge traçante puis utilisés sur 37 cultivars de fétuques fines. Une AMOVA a été réalisée sur la matrice binaire regroupant les 610 allèles obtenus. L’algorithme du Neighbor Joining a permis d’obtenir un arbre phylogénétique par le logiciel NTSYS. Enfin, l’algorithme bayesien a été utilisé pour déterminer la structure et le nombre optimal de populations par le logiciel STRUCTURE. Les résultats ont mis en évidence des couples de cultivars identiques et une variance intra-population de 76%, montrant un manque de diversité du germplasme. Les résultats de cette étude peuvent être utilisés pour différencier les fétuques fines et aider au choix des variétés. Ils peuvent être utilisés pour la mise en place d’empreintes génétiques pour l’identification voire la protection de variétés.
Type de document :
Mémoires
Sciences agricoles. 2015
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Soumis le : lundi 19 octobre 2015 - 14:52:21
Dernière modification le : mercredi 21 mars 2018 - 16:08:05
Document(s) archivé(s) le : jeudi 27 avril 2017 - 06:22:45

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Mélodie Vivès. Création et caractérisation de marqueurs SSR pour la fétuque rouge traçante - Festuca rubra subsp. Rubra - et étude de diversité génétique. Sciences agricoles. 2015. 〈dumas-01217363〉

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