Interactions médicamenteuses : données liées et applications

Résumé : Introduction : Les interactions médicamenteuses sont l’une des principales causes d’effets indésirables médicamenteux évitables. En France, le thesaurus des interactions médicamenteuses, édité par l’agence national de sécurité du médicament (ANSM), est la principale référence. Son format PDF est cependant une limite majeure à son utilisation. L’objectif principal de ce travail était de proposer un format ouvert du thesaurus et d’illustrer son intérêt au travers de deux exemples concrets : comparer le thesaurus avec d’autres sources internationales sur les interactions et utiliser son contenu pour mesurer la fréquence des interactions sur des données de délivrance. Méthodes : Nous avons développé un programme pour transformer le format PDF du thesaurus en triplets RDF, un standard du web sémantique pour l’échange de données. Les molécules décrites dans le thesaurus ont été liées à trois autres sources de données : l’Unified Medical Language System (UMLS), DrugBank (DB) et le répertoire des médicaments de l’ANSM. Le lien vers DB a permis son intégration dans une base de données internationale (merged-PDDI) sur les interactions et sa comparaison avec d’autres sources en mesurant leur chevauchement. Un programme a été développé pour mesurer la fréquence des interactions sur des données de délivrance médicamenteuse. Résultats : Dans sa version de janvier 2016, le thesaurus contient 1102 molécules et 168 classes thérapeutiques. Il décrit 1414 interactions entre classes ou molécules représentant 52870 interactions entre molécules. Parmi ces dernières, 5651 interactions (13%) ont été retrouvées dans la base merged-PDDI ce qui correspond à un chevauchement faible avec les autres sources. Nous montrons la possibilité d’utiliser ce contenu ouvert pour mesurer la fréquence des interactions sur des données de délivrance. Nous dénombrons 17112 contre- indications parmi 7 millions de délivrances entre juin et août 2013. Conclusion : Nous proposons dans ce travail un format ouvert du thesaurus des interactions de l’ANSM qui utilise les standards du web sémantique. Ce format facilite son utilisation pour la recherche et permet le développement de nouvelles applications.
Type de document :
Mémoires
Médecine humaine et pathologie. 2016
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https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-01442668
Contributeur : Bu Carreire Université de Bordeaux <>
Soumis le : vendredi 20 janvier 2017 - 18:25:26
Dernière modification le : mercredi 23 août 2017 - 16:41:10
Document(s) archivé(s) le : vendredi 21 avril 2017 - 16:34:08

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  • HAL Id : dumas-01442668, version 1

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Sébastien Cossin. Interactions médicamenteuses : données liées et applications. Médecine humaine et pathologie. 2016. 〈dumas-01442668〉

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