Capenem resistance of Pseudomonas Aeruginosa in 3 French Intensive Care Units : epidemiology of resistance mechanisms, phenotypic carbapenemase detection tests evaluation
Épidémiologie de la résistance aux carbapénèmes de Pseudomonas Aeruginosa dans 3 services de réanimation français : études des mécanismes de résistance et évaluation des tests phénotypiques de dépistage des carbapénémases
Résumé
Introduction : carbapenem resistance of Pseudomonas Aeruginosa (PA) is increasing worldwide. Carbapenemase outbreaks are sources of concern. Several rapid phenotypic diagnostic assays for carbapenemase detection have been developed and validated on enterobacteriaceae, but poorly evaluated on PA. Goal : to evaluate the epidemiology of carbapenem resistance mechanisms in PA in 3 French intensive care units (ICU). To compare the results of phenotypic carbapenemase detection tests to genotypic Gold Standard. Methods : IMIPENEM or MEROPENEM resistant PA strains from 3 French ICU were included. CLAVULANATE synergy test was used to detect ESBL (Extended-Spectrum Beta-Lactamase). Carbapenemase-producing strains were detected with the following assays : interpretative diameters reading, EDTA-based disc-test, ©Liofilchem® KPC&MBL disc kit, Mastdiscs ™ Carbapenemase Detection Set®, Mastdiscs ™ CAT-ID™, Rapidec® Carba NP-test. Multiplex PCR for ESBL and carbapenemase main genes was performed for each strain. 2 metallo-carbapenemase positive strains were included in the analysis. Results : 47 strains were analyzed. No carbapenemase was found, 2 (4.3%), were positive for ESBL, 12 (25.5%) were positive for AmpC hyperproduction, 33 (70,2%) for overexpressed efflux pumps. Interpretative reading, EDTA-based disc-test, and Rapidec® Carba NP-test showed good sensitivity and specificity. Diagnostic performances of other tests were poor. Conclusion : in this population, carbapenem resistance was mostly due to non-transferable mechanisms. Well conducted antibiogram interpretative reading and EDTA-based disc test appeared to be efficient to detect most common carbapenemases in PA. Diagnostic contribution of other tests in low-prevalence population remains shallow.
Introduction : la résistance de Pseudomonas Aeruginosa (PA), premier pathogène en réanimation, aux carbapénèmes augmente à l’échelle mondiale. L’apparition de carbapénémases est problématique. De nombreux tests rapides de dépistage des carbapénémases ont été développés chez les entérobactéries, mais peu évalués chez PA. Objectif : évaluer la part respective des différents mécanismes de résistance de PA aux carbapénèmes dans 3 services de réanimation français. Comparer les résultats des tests phénotypiques et de la lecture interprétative de l’antibiogramme au Gold Standard génotypique. Matériel et méthode : étude ancillaire du PHRC Dynapyo ayant étudié les souches de PA acquises dans 10 services de réanimation français en 2009. Les souches de PA résistantes à l’IMIPENEME et/ou au MEROPENEME issues de 3 des services étaient incluses. Les BLSE (β-lactamases à spectre étendu) étaient recherchées par synergie au clavulanate. Les carbapénémases étaient recherchées par les tests suivants : analyse de l’antibiogramme, test à l’Ethylène Diamine Tétra-Acétique (EDTA), ©Liofilchem® KPC&MBL disc kit, Mastdiscs ™ Carbapenemase Detection Set®, Mastdiscs ™ CAT-ID™, Rapidec® Carba NP-test. Les gènes de BLSE et de carbapénémases étaient recherchés par PCR. 2 souches témoins positives pour métallo-carbapénémases étaient utilisées pour comparer tests phénotypiques et génotypiques. Résultats : sur 47 souches analysées, aucune n’était porteuse de carbapénémase, 2 (4,3%) étaient porteuses de BLSE, 12 (25,5%) de céphalosporinase AmpC hyperproduite, 33 (70,2%) de mécanismes d’efflux. La lecture interprétative de l’antibiogramme, le test à l’EDTA, et le Rapidec® Carba NP-test étaient sensibles et spécifiques, comparés à la PCR. Les performances diagnostiques des autres tests étaient médiocres. Conclusion : la résistance aux carbapénèmes de PA dans cette population était principalement due à des mécanismes non-transférables. La lecture interprétative de l’antibiogramme bien conduite et le test simple à l’EDTA semblent adaptés au dépistage des carbapénémases les plus fréquentes chez PA. L’apport diagnostique d’autres tests phénotypiques en pratique courante semble mince.