Mise en place d'un algorithme décisionnel pour la détection des entérobactéries productrices de carbapénèmase (EPC) au laboratoire de bactériologie du CHU Amiens Picardie

Résumé : Introduction : les entérobactéries productrices de carbapénèmase (EPC) constituent un problème de santé publique en France, mais leur détection reste difficile. Le but de ce travail était de mettre en place un algorithme de détection des EPC incluant un test d’hydrolyse par MALDI-ToF. Matériel et méthodes : nous avons mis en place un test basé sur l’hydrolyse de l’imipénème par MALDI-ToF, à l’aide de 65 souches produisant ou non une carbapénèmase, et comparé ses performances au test Rapidec® CARBA NP. Notre algorithme de détection, basé sur des tests phénotypiques (dépistage) puis sur un test d’hydrolyse de l’imipénème (confirmation), a été évalué à l’aide d’un recueil prospectif pendant 6 mois. Résultats : le test d’hydrolyse de l’imipénème MALDI-ToF discrimine efficacement les EPC des autres souches non sensibles aux carbapénèmes. Le test a montré des performances supérieures au Rapidec® CARBA NP (sensibilités 100% et 92%, spécificités 94% et 92% respectivement). Lors du recueil prospectif, 74 souches ont été soumises à l’algorithme de détection. 54 « non EPC » ont été testées négatives, et 20 souches, dont 100% des EPC, ont été soumises au test de confirmation. Lors de ce test, 7 souches étaient positives, justifiant le recours à la biologie moléculaire et à un centre de référence. 3 d’entre elles étaient en fait des faux positifs. Discussion : la supériorité du test d’hydrolyse par MALDI-ToF peut s’expliquer par les problèmes d’interprétation du test Rapidec® CARBA NP (test colorimétrique). L’algorithme de détection s’est montré adapté à notre épidémiologie locale qui montre une très faible prévalence des carbapénèmases (0.05% en 2015, données du laboratoire). Il permet de rendre un résultat dans la journée, et de limiter le recours aux tests de biologie moléculaire onéreux. Conclusion : l’algorithme de détection incluant le test d’hydrolyse de l’imipénème par MALDI-ToF peut être mis en place en routine au laboratoire sur des souches cliniques. L’utilisation de la technologie MALDI-ToF pourra être étendue aux souches de dépistage, puis à l’étude d’autres mécanismes de résistance épidémiques.
Type de document :
Mémoires
Sciences pharmaceutiques. 2016
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Contributeur : Hélène Weens <>
Soumis le : mardi 28 mars 2017 - 10:35:43
Dernière modification le : mercredi 23 août 2017 - 16:41:40
Document(s) archivé(s) le : jeudi 29 juin 2017 - 16:40:56

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Morgane Choquet. Mise en place d'un algorithme décisionnel pour la détection des entérobactéries productrices de carbapénèmase (EPC) au laboratoire de bactériologie du CHU Amiens Picardie. Sciences pharmaceutiques. 2016. 〈dumas-01496957〉

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