Dynamique de l’évolution intra-patient du VHC par NGS

Résumé : Le séquençage haut débit des populations à évolution rapide du virus de l’hépatite C (VHC) permet des études à grande échelle de l’hétérogénéité virale intra-hôte et de la résistance aux traitements anti-viraux communément observée en infection chronique. Alors que l’échappement au traitement anti-viral direct peut être expliqué par des mutations de résistance dans des régions génomiques ciblées, l’absence de réponse à la bithérapie (interféron pegylé et ribavirine) reste moins comprise. Dans cette étude, nous avons réalisé un séquençage par amplicon pour étudier la variation génomique des régions Core et NS5B du VHC sur une période de 13 ans pour deux patients suivis pour hépatite C chronique. A partir d’échantillons obtenus à différentes dates, nous avons observé chez ces patients des infections composées de plusieurs génotypes du VHC. L’hétérogénéité génétique et l’analyse de la composition des échantillons a fourni des informations sur les changements dans la population virale au cours du traitement, avec NS5B qui a connu une forte augmentation de diversité après l’initiation du traitement. Des données supportant une structure génétique de population du VHC ont été observées chez tous les patients. Ces observations orientent vers une sélection diversifiante se produisant après traitement, agissant à variation génomique constante et maintenant une grande hétérogénéité génétique durant l’infection. Associés à l’efficacité du traitement, ces résultats fournissent la première preuve à l’occasion d’un traitement anti-viral d’induction de «réduction de variation sélective douce» («soft selective sweeps») chez des patients infectés chroniques avec plusieurs génotypes du VHC.
Type de document :
Mémoires
Médecine humaine et pathologie. 2017
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Contributeur : Jean-Hugues Morneau <>
Soumis le : jeudi 26 octobre 2017 - 11:27:02
Dernière modification le : lundi 29 octobre 2018 - 23:06:45
Document(s) archivé(s) le : samedi 27 janvier 2018 - 13:25:34

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Alban Caporossi. Dynamique de l’évolution intra-patient du VHC par NGS. Médecine humaine et pathologie. 2017. 〈dumas-01624390〉

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