Étude et définition d’une ontologie pour l’interprétation des exomes cancéreux

Résumé : Le projet ICE (Interpretation of Clinical Exom) est un projet ambitieux qui vise à implémenter un outil innovant pour une approche prédictive de la lutte contre le cancer. Ce projet est mené par un consortium regroupant des partenaires de différents domaines d’expertises dont Sogeti High Tech mon employeur, une société de service informatique qui est en charge de développer l’outil. C’est un défi qui nous est lancé et qui commande que nous nous appuyons sur les technologies Big Data en raison du volume des données issues du séquençage des gènes et de leurs exploitations dans la lutte personnalisée du cancer. Un ensemble de ressources sont déjà disponibles décrivant les gènes, leurs mutations, les cancers, les molécules actives médicamenteuses, les essais cliniques et leurs publications scientifiques. Ces différents domaines de connaissance sont modélisés sous forme d'ontologies. L'objectif de ce travail est d’étudier et de concevoir une ontologie pivot alignant les ontologies existantes et les particularités des patients pour permettre l'interprétation clinique des mutations des gènes et une lutte personnalisée du cancer la mieux adaptée pour chaque patient par l'émergence de nouvelles connaissances contextuelles à chaque individu. Pendant six mois j’ai donc cherché à créer cette ontologie dont la particularité consiste à trouver les solutions pour faire le mapping. Le mémoire que je vous présente est le résultat de six mois passés au sein de l’Equipe de recherche ICE de Sogeti High Tech pour concevoir cette ontologie pivot et la mise en place des technologies afférentes, fondement du prototype du futur système d'information à l'usage des cliniciens en cancérologie.
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Mémoires
Ingénierie, finance et science [cs.CE]. 2016
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Soumis le : lundi 20 novembre 2017 - 10:48:07
Dernière modification le : jeudi 24 mai 2018 - 15:58:12
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Laurence Gine I Cortiella. Étude et définition d’une ontologie pour l’interprétation des exomes cancéreux. Ingénierie, finance et science [cs.CE]. 2016. 〈dumas-01638394〉

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