Création et analyse d'un système d'information géographique des foyers de flavescence dorée dans le vignoble bordelais - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Access content directly
Master Thesis Year : 2019

Creation and analysis of a geographical information system of flavescence dorée focuses in the bordelais vineyard

Création et analyse d'un système d'information géographique des foyers de flavescence dorée dans le vignoble bordelais

Abstract

Flavescence dorée is a quarantine disease of grapevine, caused by a phytoplasma and transmitted by the leafhopper Schaphoideus titanus. The vineyards survey is one of the cornerstone to manage the disease. The objective of this intership was to (i) create a reliable Geographic Information System (GIS) of flavescence dorée focuses in the territory of GDON des Bordeaux and (ii) study the dynamics of the disease in this territory. Different sources of data (GDON with FD observations between 2012 ans 2017, CVI with data on cultivars, CESBIO with data on land occupation) were combined. If this process results to a lose of information, the GIS created contains 40 246 plots informed on 38 variables. The analysis of this database was focused on the infectious status of individual fields during the first prospection year. As a high spatial autocorrelation was present, these binary data were analysed with a spatially explicit GLM model fitted with the INLA method. Thereby, the plantation year, Merlot and Semillon cultivars, the proportion of grapevine and forest in landscape have a negative effect on the probability to observe the disease, whereas the presence of Cabernet-Sauvignon, the number of insecticides, and the proportion of urban have a positive effect on the presence of the disease. This constitutes the premises of a model of prediction of risk maps of FD which may guide, in a better way, the prospection strategy.
La flavescence dorée (FD) est une maladie de quarantaine qui touche la vigne, causée par un phytoplasme et transmise par la cicadelle Scaphoideus titanus. La surveillance des parcelles viticoles est un des piliers de gestion de la maladie. L’objectif de ce stage était de réaliser un Système d’Information Géographique (SIG) fiable des foyers de FD dans le territoire du GDON des Bordeaux dans le but d’étudier les dynamiques de la maladie dans les zones prospectées par le GDON. Plusieurs sources de données (GDON avec les observations FD entre 2012 et 2017, CVI pour les informations sur les cépages, CESBIO pour les données d’occupation du sol) ont été combinées. Si la fusion de ces bases a entrainé une perte de l’information par rapport à l’ensemble des prospections GDON, le SIG créé contient 40246 parcelles renseignées sur 38 champs. L’analyse de cette base s’est focalisée sur le statut infectieux des parcelles lors de la première année de prospection. Une forte autocorrélation spatiale étant présente, ces données binaires ont été analysées avec un modèle glm spatialement explicite estimé avec la méthode INLA. Ainsi, l’année de plantation, les cépages Merlot et Sémillon, la proportion de vigne et de forêt dans le paysage ont un effet négatif sur la probabilité d’observer la maladie, tandis que le Cabernet-Sauvignon, le nombre de traitements insecticides, et la proportion d’urbain dans le paysage ont un effet positif sur la présence de FD. Cela constitue les prémisses d’un modèle de prédiction de cartes de risques FD qui permettra de mieux guider la stratégie de prospection.
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Origin : Files produced by the author(s)
Comment : Rajouter parcours : Agroécologie et GEstion des Ressources (AGROGER)

Dates and versions

dumas-02388891 , version 1 (14-10-2020)

Identifiers

  • HAL Id : dumas-02388891 , version 1

Cite

Lovasoa Ramalanjaona. Création et analyse d'un système d'information géographique des foyers de flavescence dorée dans le vignoble bordelais. Sciences du Vivant [q-bio]. 2019. ⟨dumas-02388891⟩
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