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Master Thesis Year : 2020

Diagnostic accuracy of a rapid RT-PCR assay for point-of-care detection of Influenza A/B virus at emergency department admission: a prospective evaluation during the 2017/2018 influenza season

Évaluation des performances d'un test de diagnostic rapide de grippe A et B par RT-PCR à l’accueil des urgences : étude prospective pendant l’épidémie 2017-2018

Abstract

Study objective: To investigate the performance of a rapid RT-PCR assay to detect influenza A/B at emergency department admission. Methods: This single-center prospective study recruited adult patients attending the emergency department for influenza-like illness. Triage nurses performed nasopharyngeal swab samples and ran rapid RT-PCR assays using a dedicated device (cobas® Liat, Roche Diagnostics, Meylan, France) located at triage. The same swab sample was also analyzed in the department of virology using conventional RT-PCR techniques. Patients were included 24 hours-a-day, 7 days-a-week. The primary outcome was the diagnostic accuracy of the rapid RT-PCR assay performed at triage. Results: A total of 187 patients were included over 11 days in January 2018. Median age was 70 years (interquartile range 44 to 84) and 95 (51%) were male. Nine (5%) assays had to be repeated due to failure of the first assay. The sensitivity of the rapid RT-PCR assay performed at triage was 0.98 (95% confidence interval (CI): 0.91 – 1.00) and the specificity was 0.99 (95% CI: 0.94 – 1.00). A total of 92 (49%) assays were performed at night-time or during the weekend. The median time from patient entry to rapid RT-PCR assay results was 46 [interquartile range 36 – 55] minutes. Conclusion: Rapid RT-PCR assay performed by nurses at triage to detect influenza A/B is feasible and highly accurate.
Introduction : Des dispositifs innovants de diagnostic rapide de la grippe par réaction en chaine polymérase en temps réel (RT-PCR), au chevet du patient, ont été récemment développé mais il n’existe pas d’évaluation en milieu clinique de la fiabilité de ces tests. L’objectif de cette étude est d’évaluer les performances diagnostiques d’un test rapide RT-PCR de grippe réalisé par les infirmiers d’accueil et d’orientation (IAO) aux urgences. Méthode : Cette étude était prospective monocentrique au Centre Hospitalier-Universitaire de Grenoble. Les patients inclus étaient des adultes se présentant aux urgences avec des symptômes grippaux. Les IOA réalisaient 24h/24 et 7j/7 un prélèvement nasopharyngé, lequel était immédiatement testé grâce à un dispositif dédié (Cobas® Liat Roche Diagnostics, Meylan, France) situé dans la zone de triage. L’échantillon nasopharyngé était aussi analysé par une méthode RT-PCR classique au laboratoire. Le critère de jugement principal était les performances diagnostiques du test RT-PCR rapide réalisé à l’accueil des urgences. Résultats : 187 patients ont été inclus en 11 jours en janvier 2018. L’âge médian des patients était de 70 (interquartile (IQ) 44 – 84) ans. La sensibilité du test RT-PCR rapide à l’accueil des urgences était de 0,98 (Intervalle de confiance IC à 95% 0,91 – 1) et la spécificité était de 0,99 (IC95% 0,94 – 1). 92 (49%) tests étaient réalisés durant la nuit ou le weekend. Le temps médian entre l’arrivée du patient à l’accueil des urgences et le résultat du test était 46 (IQ 36 – 51) minutes. Conclusion : Un test RT-PCR rapide réalisé par les IAO dès l’accueil des urgences est applicable en pratique et performant.
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dumas-02543194 , version 1 (15-04-2020)

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Cite

Maud Hablot. Diagnostic accuracy of a rapid RT-PCR assay for point-of-care detection of Influenza A/B virus at emergency department admission: a prospective evaluation during the 2017/2018 influenza season. Human health and pathology. 2020. ⟨dumas-02543194⟩
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