Analyse de multiples blocs de données compositionnelles : application à l'étude de la sous-nutrition chronique - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2019

Analysis of multiple compositional datasets : application to chronic undernutrition

Analyse de multiples blocs de données compositionnelles : application à l'étude de la sous-nutrition chronique

Antoine Ménard
  • Fonction : Auteur

Résumé

Growth delay syndrome affects a quarter of the children who are under five. It is to better understand the links between growth delay and undernutrition that the Afribiota project was set up. This reports presents the work realised in order to integrate the compositional datasets generated by this study and to detect biomarkers of growth delay. The processus and the importance of the integration of the compositional aspect of the data are detailed. Then, a methodology of integration for a single block and two methodologies for multiple blocks are proposed, as well as differential analysis methods. It result that undernutrition generate modifications of the intestinal ecosystem, and more paticularly an imbalance of bacterial populations and a modification of the bile acid relative abondances.
Le retard de croissance touche un quart des enfants de moins de cinq ans dans le monde. C’est pour mieux comprendre les liens entre malnutrition et retard de croissance que s’est mis en place le projet Afribiota. Ce rapport présente le travail réalisé pour intégrer les jeux de données compositionnelles de générés par cette étude pour pouvoir identifier des biomarqueurs du retard de croissance. Le processus et l’importance de l’intégration de l’aspect compositionnel des données sont présentés. Puis, une méthodologie d’intégration par bloc et des méthodes d’intégration multiblocs sont proposées, ainsi que différentes méthodes d’analyses différentielle. Il en résulte que la sous-nutrition chronique engendre un dérèglement de l’écosystème intestinal, un dérèglement des populations bactériennes et des abondances en acides biliaires.
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Identifiants

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Citer

Antoine Ménard. Analyse de multiples blocs de données compositionnelles : application à l'étude de la sous-nutrition chronique. Sciences du Vivant [q-bio]. 2019. ⟨dumas-02746065⟩
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