Analyse de multiples blocs de données compositionnelles : application à l'étude de la sous-nutrition chronique - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Access content directly
Master Thesis Year : 2019

Analysis of multiple compositional datasets : application to chronic undernutrition

Analyse de multiples blocs de données compositionnelles : application à l'étude de la sous-nutrition chronique

Antoine Ménard
  • Function : Author

Abstract

Growth delay syndrome affects a quarter of the children who are under five. It is to better understand the links between growth delay and undernutrition that the Afribiota project was set up. This reports presents the work realised in order to integrate the compositional datasets generated by this study and to detect biomarkers of growth delay. The processus and the importance of the integration of the compositional aspect of the data are detailed. Then, a methodology of integration for a single block and two methodologies for multiple blocks are proposed, as well as differential analysis methods. It result that undernutrition generate modifications of the intestinal ecosystem, and more paticularly an imbalance of bacterial populations and a modification of the bile acid relative abondances.
Le retard de croissance touche un quart des enfants de moins de cinq ans dans le monde. C’est pour mieux comprendre les liens entre malnutrition et retard de croissance que s’est mis en place le projet Afribiota. Ce rapport présente le travail réalisé pour intégrer les jeux de données compositionnelles de générés par cette étude pour pouvoir identifier des biomarqueurs du retard de croissance. Le processus et l’importance de l’intégration de l’aspect compositionnel des données sont présentés. Puis, une méthodologie d’intégration par bloc et des méthodes d’intégration multiblocs sont proposées, ainsi que différentes méthodes d’analyses différentielle. Il en résulte que la sous-nutrition chronique engendre un dérèglement de l’écosystème intestinal, un dérèglement des populations bactériennes et des abondances en acides biliaires.
Fichier principal
Vignette du fichier
2019_MENARD_Antoine_Sciences_des_données.pdf (1.28 Mo) Télécharger le fichier
Origin Files produced by the author(s)
Loading...

Dates and versions

dumas-02746065 , version 1 (03-06-2020)

Licence

Identifiers

  • HAL Id : dumas-02746065 , version 1

Cite

Antoine Ménard. Analyse de multiples blocs de données compositionnelles : application à l'étude de la sous-nutrition chronique. Sciences du Vivant [q-bio]. 2019. ⟨dumas-02746065⟩
59 View
33 Download

Share

Gmail Mastodon Facebook X LinkedIn More