Animal Movement Cleaner Application : un outil de pré-traitement des données de biologging - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Access content directly
Master Thesis Year : 2019

Animal Movement Cleaner Application: a pre-treatment tool for bio-logging data

Animal Movement Cleaner Application : un outil de pré-traitement des données de biologging

Abstract

Bio-logging consists in using miniaturised tags to uncover animals’ hidden lives. It gives access to former unreachable data. Resulting data are usually welcomed with eagerness, but caution should also be added. Indeed, Raw data may contain outliers which could skew analysis if kept. Hence, the present dissertation deals with the development of a pre-treatment tool for those datasets. First of all, outliers’ origins have been described depending on the geolocation technology. After that, a need analysis led to the conclusion that a new tool doing automated pre-treatment to remove outliers would only be useful if it is easy to use and if the user has the final word. The tool must also work for any species, any geolocation technology and any dataset structure. Those parameters have been considered during AMCA, Animal Movement Cleaner Application, development. It is a web application which purpose is to eliminate impossible data and data with out-of-range speed. It is also able to detect immobility. Currently, AMCA is working for GPS technology and Movebank data structure. Easy to use, it also enables users to modify algorithms-kept and eliminated data thanks to a 3D visualization.
Le bio-logging consiste à utiliser des balises miniaturisées pour dévoiler les comportements des animaux sauvages. Il permet l’accès à une connaissance jusqu’alors hors de portée. Bien que les données récoltées soient accueillies avec enthousiasme, elles doivent également l’être avec prudence. En effet, les jeux de données brutes peuvent contenir des données aberrantes qui fausseraient les résultats si elles étaient conservées lors de l’analyse. Ce mémoire s’intéresse au développement d’un outil de pré-traitement de ces jeux de données. Dans un premier temps, les origines des localisations aberrantes en fonction de la technologie de géolocalisation ont été décrites. Ensuite, une analyse des besoins a mis en avant que l’intérêt d’un nouvel outil automatisant le pré-traitement des données aberrantes réside dans sa facilité d’utilisation et dans la place de l’utilisateur en tant que décideur final. Il doit également pouvoir fonctionner pour toutes les espèces, toutes les technologies de géolocalisation et prendre en compte tous les formats de données. AMCA, Animal Mouvement Cleaner Application, a donc été développée en prenant en compte tous ces paramètres. Il s’agit d’une application web éliminant les données impossibles et celles présentant une vitesse aberrante, en plus de détecter une immobilité. Elle fonctionne actuellement pour la technologie GPS et le format de données de Movebank®. Ses atouts sont sa facilité d’utilisation et la visualisation 3D laissant l’utilisateur libre de modifier les résultats des algorithmes.
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Dates and versions

dumas-02968237 , version 1 (22-10-2020)

Identifiers

  • HAL Id : dumas-02968237 , version 1

Cite

Aurélie Jambon. Animal Movement Cleaner Application : un outil de pré-traitement des données de biologging. Informatique [cs]. 2019. ⟨dumas-02968237⟩
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