Les patients avec épilepsie présentent une altération du système nerveux autonome, notamment cardiaque. Cette atteinte pourrait représenter un facteur de risque de SUDEP, principale cause de décès chez les patients adultes épileptiques. L'objectif de notre étude était d'identifier le rôle de la durée d'évolution, de la pharmacorésistance et du type d'épilepsie dans l'atteinte dysautonomique des patients épileptiques, via l'étude de la variabilité de la fréquence cardiaque en période inter-ictale. Nous avons réalisé une étude rétrospective multicentrique de janvier 2017 à mars 2020 au CHU d'Amiens et de Lille portant sur des patients avec épilepsie ayant bénéficié d'un enregistrement EEG et ECG prolongé de veille et de sommeil. Les indices temporels et fréquentiels de la variabilité de la fréquence cardiaque ont été calculés au repos et lors du sommeil de stade 2, à distance d'une crise focale ou généralisée, clinique ou électrique, d'une stimulation ou d'un repas. Nous avons analysé les liens entre ces différents indices et les caractéristiques des épilepsies des patients. Cent-dix huit patients ont été inclus. Nous avons mis en évidence une diminution de la variabilité de la fréquence cardiaque globale lors du sommeil stade 2 dans les épilepsies pharmacorésistantes indépendamment de la durée d'évolution et du type d'épilepsie, une diminution de la variabilité de la fréquence cardiaque globale nocturne associée à une moindre hypertonie parasympathique nocturne dans les épilepsies de plus de 10 ans indépendamment de l'âge et de la pharmacorésistance. Il n'a pas été mis en évidence de différences significatives concernant les mesures de la variabilité de la fréquence cardiaque entre les différents types d'épilepsie après régression linéaire sur les facteurs de confusion à savoir l'obésité, la pharmacorésistance, et la présence d'une lésion cérébrale. L'altération de la fonction autonomique cardiaque est plus importante dans les épilepsies pharmacorésistantes et dans les épilepsies de longue durée d'évolution. Cette altération prédomine durant le sommeil. La prédominance nocturne de l'altération de la fonction autonomique cardiaque dans les épilepsies anciennes et pharmacorésistantes renforce l'hypothèse du lien entre dysfonction autonomique cardiaque et SUDEP.