Indicateurs et DataVisualisation de la qualité de prise en charge des Sarcomes : création de l’application VizaSarc - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Access content directly
Master Thesis Year : 2020

Data Visualization and Quality indicators of Sarcomas management: development of VizaSarc application

Indicateurs et DataVisualisation de la qualité de prise en charge des Sarcomes : création de l’application VizaSarc

Abstract

Introduction: the management of sarcomas is complex because of their rarity and heterogeneity. Poor diagnostic and surgical practices decrease patient survival. In 2010, a network of expert centers was formed and a national database (Sarcoma BCB) was created. The objective was to develop an application for the automatic calculation of management quality indicators from national data and with data visualization tools. Method: a multidisciplinary group of 7 experts defined 9 indicators. The study population was soft tissue and bone sarcomas diagnosed between 2010 and 2019 in an adult patient. The app was developed with R Shiny. Results: the dashboard displays indicators over a year, for a center or nationally. The visual tools are an interactive flowchart, overall survival curve, bar, donut, and Euler charts. In 2019, indicators M1 (imaging), M2 (size / depth), M3a (biopsy), M5 (re-reading addressed) and O1 (biopsy) are greater than 75%, M3b (microbiopsy) and M4a (R0 inside network) are slightly greater than 50%, M4b (R0 outside network) and M6 (cryopreservation) are 27% and 38%. M1, M3 and O1 indicators have evolved positively since 2010. M4 indicators have started to decrease. Discussion: the application allows a quick visualization of the state of practices and their evolution. Sankey diagram and donut charts help practitioners to explore and better understand the results. Despite encouraging results, moderate and low adequacy rates of some indicators show we need to continu efforts to improve the management of sarcomas.
Introduction : la rareté et l’hétérogénéité des Sarcomes rendent leur prise en charge complexe. Les mauvaises pratiques diagnostics et chirurgicales entraînent une perte de chance pour le patient. En 2010, un réseau de centres experts est formé avec la création d’une base de données nationale (BCB Sarcomes). L’objectif était de développer une application permettant le calcul automatique d’indicateurs de la qualité des pratiques, à partir des données nationales, et disposant d’outils de datavisualisation. Méthode : un groupe pluridisciplinaire de 7 experts a défini 9 indicateurs. La population d’étude était les sarcomes des tissus mous et des os diagnostiqués entre 2010 et 2019 chez un patient majeur. L’application a été développée avec R Shiny. Résultats : le tableau bord affiche les indicateurs sur une année, pour un centre ou au niveau national. Les outils visuels sont un diagramme de flux interactif, une courbe de survie globale, des diagrammes à barres, en anneaux et d’Euler. En 2019, les indicateurs M1 (imagerie), M2 (taille/profondeur), M3a (biopsie), M5 (relecture adressée) et O1 (biopsie) sont supérieurs à 75 %, M3b (microbiopsie) et M4a (R0 réseau) sont légèrement supérieurs à 50 %, M4b (R0 hors réseau) et M6 (cryopréservation) sont de 27 % et 38 %. Les indicateurs M1, M3 et O1 ont évolués positivement depuis 2010. Les indicateurs M4 sont en légère baisse. Discussion : l’application permet une visualisation rapide de l’état des pratiques et de leur évolution. Le diagramme de Sankey et les diagrammes en anneaux permettent aux praticiens d’explorer et de mieux comprendre les résultats. Malgré des résultats encourageant, les taux d’adéquation modérés et faibles de certains indicateurs montrent qu’il est nécessaire de poursuivre les efforts afin d’améliorer la prise en charge des Sarcomes.
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Med_Spe_2020_Queroue.pdf (20.55 Mo) Télécharger le fichier
Origin : Files produced by the author(s)

Dates and versions

dumas-03012550 , version 1 (18-11-2020)

Identifiers

  • HAL Id : dumas-03012550 , version 1

Cite

Marine Quéroué. Indicateurs et DataVisualisation de la qualité de prise en charge des Sarcomes : création de l’application VizaSarc. Sciences du Vivant [q-bio]. 2020. ⟨dumas-03012550⟩
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