Méthodologie statistique pour étudier l'empreinte parentale dans le cadre des études d'association pan-génomique -Etude de l'association entre le gène ABO et le facteur de Willebrand dans la maladie thromboembolique veineuse
Résumé
The Venous ThromboEmbolism (VTE) is the 3rd most frequent vascular disease in Europe and is responsible of around 10 000 deaths per year in France. It results from blood clot forms (thrombus) which can obstruct blood circulation. Last genome wide association studies identified a thirties genes associated with this disease, including ABO gene which determines blood group. Genome wide association studies permit to identify genetics polymorphisms involved in quantitative or qualitative traits variances but is based on the assumption of parental origin effect absence. However some works have shown parental origin of the allele can increase thrombos disease risk depending if the allele is herited from the father or the mother. Thus, in this research intership, using a new methodology based on Brown-Forsythe test applied on 2 643 individuals, A1 group has been revealed potentially prone to parental imprinting on the von Willebrand factor (vWF). This hypothese is confirmed on a family data where vWF was significantly lower when a child has herited A1 allele from his father rather than his mother ; which can show that this parental origin effect is potentially paternal.
La maladie thromboembolique veineuse (MTEV) est la 3ème maladie cardiovasculaire la plus fréquente et est responsable d’environ 10 000 décès chaque année en France. Elle résulte de la formation d’un thrombus (caillot de sang) dans le système veineux qui peut obstruer la circulation sanguine. Les dernières études d’association pan-génomiques ont identifié une trentaine de gènes associés à cette pathologie, dont le gène ABO qui est responsable du groupe sanguin. Les études d’association pangénomiques permettent d’identifier les polymorphismes génétiques impliqués dans la variabilité d’un trait quantitatif ou qualitatifs, mais repose sur l’hypothèse d’absence d’empreinte parentale au niveau des polymorphismes testés. Cependant quelques travaux ont montré que l’origine de l’allèle peut augmenter le risque de développer une maladie s’il a été hérité du père ou de la mère. Ainsi, dans ce rapport, l’objectif était d’étudier l’empreinte parentale du gène ABO sur le taux plasmatique de Willebrand, une variable biologique qui peut augmenter le risque de développer une MTEV. Ainsi, grâce à une nouvelle méthodologie basée sur la méthode de Brown-Forsythe appliquée sur 2643 individus, le groupe A1 s’est révélé être potentiellement soumis à empreinte parentale sur le taux de Willebrand. Cette hypothèse a pu être validée dans une étude de données familiales où le taux de Willebrand était significativement plus bas quand un enfant a hérité l’allèle A1 de son père plutôt que de sa mère ; ce qui pourrait montrer que cette empreinte serait une empreinte parentale paternelle.